若发现多付了工程款，可按照以下法律申请步骤来追回款项：

1. 收集证据

   • 合同文件：首先，要仔细审查与承包商签订的工程合同，确认合同中的付款条款、工程范围、总价等关键信息。
   • 付款记录：整理所有与工程款支付相关的记录，包括银行转账记录、支票存根、收据等，以证明实际支付的金额。
   • 工程验收报告：如果工程已经完成并验收，收集验收报告或相关文件，确认工程实际完成情况和质量。
   • 沟通记录：保留与承包商就多付款项事宜进行的所有沟通记录，如邮件、短信、电话录音等，以证明你方已发现多付款项并尝试与对方协商。

2. 与承包商协商

   • 在收集到足够证据后，应首先尝试与承包商进行友好协商，说明多付款项的情况，并要求对方退还多余部分。
   • 协商过程中，可以提出具体的退款方案，如分期退款、一次性退款等，并尽量达成书面协议，以确保双方权益。

3. 发送律师函

   • 如果协商无果，可以考虑委托律师发送律师函给承包商，正式要求对方退还多付的工程款。
   • 律师函应详细阐述多付款项的事实、法律依据以及你方的要求，并设定合理的退款期限。

4. 提起诉讼或申请仲裁

   • 若承包商在收到律师函后仍未退还多付款项，你可以根据合同中的争议解决条款，选择向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁。
   • 在提起诉讼或申请仲裁前，应确保已准备好所有相关证据，并咨询专业律师以制定合适的诉讼或仲裁策略。

5. 执行判决或裁决

   • 如果法院或仲裁机构最终判决或裁决承包商退还多付的工程款，但对方仍不履行义务，你可以向法院申请强制执行。
   • 强制执行过程中，法院可以采取多种措施来迫使对方履行义务，如查封、扣押、拍卖财产等。

在处理多付工程款问题时，还需注意以下几点：

• 及时行动：一旦发现多付款项，应尽快采取行动，以免超过诉讼时效或给对方造成不必要的困扰。
• 保持冷静：在处理过程中，保持冷静和理性，避免与对方发生不必要的冲突或争执。
• 寻求专业帮助：如果对法律程序不熟悉或遇到复杂情况，建议及时咨询专业律师以获取专业指导和帮助。

在处理多付工程款问题时，务必确保所有行动都符合法律法规的要求，并尽量通过友好协商的方式解决问题。如果协商无果，再考虑采取法律手段来维护自己的合法权益。