针对您提出的问题，即亲子鉴定显示为母女关系但户口本上登记的是姑侄关系，法律关系应以哪个为准，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

首先，我们需要明确的是，亲子关系是一种基于血缘或法律拟制的直接亲属关系，它受到法律的保护和规范。而户口本作为我国公民身份和家庭关系的重要法律文件，其登记内容应当真实、准确反映公民的家庭关系状况。

1. 亲子鉴定的法律效力：

   • 亲子鉴定是通过科学手段对亲子关系进行确认的一种方法，其结果具有高度的准确性和权威性。
   • 在法律上，亲子鉴定结果通常被视为确认亲子关系的重要证据，尤其是在当户口本或其他法律文件上的登记与实际情况不符时。

2. 户口本的法律地位：

   • 户口本是我国公民身份和家庭关系的基本法律文件，是办理各种法律事务的重要依据。
   • 然而，户口本上的登记内容并非绝对不可更改。当发现登记内容与实际情况不符时，公民有权向相关部门申请更正。

3. 法律关系的确定：

   • 在您的情况下，亲子鉴定已经明确显示了母女关系，这是基于血缘的直接亲属关系，具有法律上的确认效力。
   • 户口本上登记的姑侄关系，如果与实际情况不符，且没有其他法律文件或证据支持这一登记，那么这一登记应当被视为错误或无效。

4. 如何解决：

   • 您应当首先收集亲子鉴定报告等证据材料，以证明实际的母女关系。
   • 然后，您可以向当地公安机关或户籍管理部门提出申请，要求更正户口本上的登记内容。
   • 如果相关部门拒绝更正或拖延处理，您还可以考虑通过法律途径解决，如向人民法院提起诉讼，请求确认亲子关系并更正户口本登记。

5. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，对亲子关系有异议且有正当理由的，成年子女可以向人民法院提起诉讼，请求确认亲子关系。
   • 同时，户口本作为公民身份和家庭关系的重要法律文件，其登记内容应当真实、准确。当发现登记内容与实际情况不符时，公民有权申请更正。

综上所述，法律关系应当以亲子鉴定结果为准。您应当积极收集证据材料，并向相关部门提出申请更正户口本上的登记内容。如果遇到困难或拒绝，可以考虑通过法律途径解决。