不批捕后退缴非法所得的处理方式需结合具体情形判断，主要分为以下两种情况：

1. 案件进入审查起诉阶段后的处理
   若检察机关作出不批捕决定后，案件退回公安机关补充侦查或直接进入审查起诉阶段，退缴的非法所得通常由公安机关暂扣并随案移送。此时需注意：

   • 证据关联性：退缴行为可能被视为认罪态度表现，但需结合其他证据（如犯罪事实认定、主观故意等）综合判断是否构成犯罪。若最终认定不构成犯罪，退缴款项应依法返还；若构成犯罪，则作为违法所得予以没收。
     
   • 程序要求：根据《刑事诉讼法》第300条，经查明确属违法所得的，应当依法予以追缴或责令退赔。退缴时需要求公安机关出具扣押清单，并保留转账记录、收据等凭证，避免后续权属争议。

2. 不批捕后终止侦查或撤销案件的处理
   若公安机关认为不批捕决定意味着证据不足或情节轻微，可能终止侦查或撤销案件。此时退缴的非法所得处理方式为：

   • 返还程序：依据《公安机关办理刑事案件程序规定》第288条，对查封、扣押的财物，经查明确与案件无关的，应在3日内解除查封、扣押并退还。若退缴款项被认定为与案件无关，可向公安机关申请返还，必要时可提起行政诉讼或国家赔偿。
     
   • 例外情形：若退缴款项涉及其他民事纠纷（如赃款已被第三人合法取得），可能需通过民事诉讼程序解决权属问题，此时需委托律师调查资金流向、交易背景等证据。

实务建议：

• 退缴前应要求公安机关出具《扣押决定书》，明确款项性质（如“涉案财物”或“保证金”），避免被认定为“自愿赠与”导致无法追回。
  
• 若案件长期未结，可依据《刑事诉讼法》第117条向检察机关申请立案监督，或直接向法院提起刑事自诉（仅限部分罪名），推动程序进展。
  
• 退缴行为可能影响量刑，但需以“认罪认罚”为前提。若仅退缴但不认罪，可能被认定为“退赃不悔罪”，反而对辩护不利。

如有具体案件细节（如退缴金额、案件阶段、罪名类型等），可进一步提供信息以便针对性分析。