结论前置：小区绿化被占用种菜一般是违法的，这种行为不仅违反了相关法律法规，还侵害了小区的公共利益和其他业主的合法权益。
法律角度分析
违反《中华人民共和国民法典》：
- 根据《民法典》第二百七十四条，建筑区划内的绿地，除非属于城镇公共绿地或明示属于个人，否则属于业主共有。未经其他业主同意，在公共绿地种菜侵犯了全体业主的共同利益，构成对他人合法权益的侵害。其他业主有权要求种菜者停止侵害、恢复原状。
- 同时，根据《民法典》第二百八十六条，业主应当遵守法律、法规以及管理规约，相关行为应当符合节约资源、保护生态环境的要求。对于任意弃置垃圾、排放污染物或者噪声、违反规定饲养动物、违章搭建、侵占通道等损害他人合法权益的行为，业主大会或者业主委员会有权依照法律、法规以及管理规约，请求行为人停止侵害、排除妨碍、消除危险、恢复原状、赔偿损失。
违反《物业管理条例》：
- 《物业管理条例》规定，业主应遵守管理规约，不得擅自改变物业使用性质或占用公共区域。在小区公共区域种菜改变了绿地的使用性质，违反了物业管理条例的相关规定，物业公司有权要求整改。
违反城市绿化管理相关法规：
- 许多城市有专门的城市绿化管理条例，明确禁止擅自占用城市绿化用地。小区内的绿地属于城市绿化的一部分，种菜属于擅自改变绿化用地用途的违法行为，城市绿化行政主管部门有权责令停止并恢复原状，还可能处以罚款。
实际影响与后果
破坏小区环境：
- 绿化带是小区的重要组成部分，对于提升小区的整体美观度和居住环境质量具有重要作用。占用绿化带种菜会破坏原有的植被和生态平衡，影响小区的整体美观度和居住环境。
增加管理难度与成本：
- 种菜活动如浇水、施肥、除草等可能增加物业管理的复杂性和成本。不当管理还可能导致积水、滑倒等安全隐患，影响居民出行安全。
引发邻里纠纷：
- 如果因种菜引发邻里之间的纠纷，如影响他人正常生活、通风、采光等，还可能触犯《民法典》中关于相邻关系的规定，需承担相应的民事责任。
处理建议
沟通与协商：
- 发现违规行为后，业主或物业应首先尝试与行为人进行友好沟通，解释相关法律法规和管理规定，指出其行为的不当之处，并要求其停止侵占绿化区域、恢复原状。
书面通知与整改：
- 如果沟通协商未能解决问题，物业应向违规的业主或行为人发出书面的整改通知。通知应明确指出其行为的违法违规之处，要求其在规定的期限内自行清除菜苗、恢复绿化，并告知逾期不整改可能面临的法律后果。
向相关部门投诉：
- 若行为人仍拒不整改，物业或业主可以向当地城管部门投诉，城管部门有权对违法行为进行查处，责令行为人限期改正，并可根据情节轻重处以罚款。同时，也可以向街道办事处或社区居委会求助，他们可以介入调解，组织相关方进行协商，推动问题的解决。
法律诉讼：
- 若上述措施均无法解决问题，业主委员会可作为原告，以维护全体业主的公共利益为由，向人民法院提起诉讼，要求行为人停止侵害、排除妨碍、恢复原状，并赔偿因破坏绿化区域给小区造成的损失。受影响的单个业主也可以提起相邻权诉讼，要求行为人消除影响、赔偿损失。
总结：小区绿化被占用种菜是违法的，不仅违反了相关法律法规，还侵害了小区的公共利益和其他业主的合法权益。建议业主在享受小区公共资源的同时，务必遵守相关法律法规和物业管理规定，共同维护小区的美好环境和居住体验。如果有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。