结论：改装的水果箱车（假设为普通货车改装成水果箱车或类似非标准车辆）发生交通事故后，保险是否赔偿需分情况讨论，主要取决于改装是否合法、是否履行了告知义务以及事故是否与改装直接相关。以下是具体分析：

1. 改装合法性是关键前提
   根据《道路交通安全法》第十六条，任何单位或个人不得擅自改变机动车已登记的结构、构造或特征。若水果箱车属于非法改装（如私自加装货箱、改变车辆用途等），则车辆可能面临年检不合格、被交警查处等风险。此时发生事故，保险公司可能以“车辆非法改装导致危险程度显著增加”为由拒赔（《保险法》第五十二条）。

2. 合法改装且履行告知义务
   若改装经过车管所备案并合法变更登记（如将普通货车合法改装为专用运输车），且投保时已向保险公司如实告知改装情况并调整保费，则保险公司通常需按合同赔偿。但需注意：若事故直接由改装部分导致（如货箱固定不牢引发货物散落伤人），保险公司可能主张免责，需结合具体条款和事故原因判断。

3. 未告知改装的法律后果
   若改装合法但未告知保险公司，根据《保险法》第十六条，保险公司有权解除合同或拒赔。但若保险公司明知改装仍承保，或事故与改装无因果关系（如对方全责的追尾事故），则保险公司仍需赔偿。

建议：

• 立即检查车辆改装是否合法，若非法需尽快恢复原状或补办手续；
  
• 联系保险公司确认改装是否影响保单效力，必要时补充告知并调整保费；
  
• 保留改装发票、备案证明等证据，以便事故后主张权益；
  
• 若遭拒赔，可委托律师审核保险合同条款，通过诉讼争取合理赔偿。
  

如有进一步细节（如改装类型、事故责任认定等），可直接向我咨询，我会结合具体情形为您分析。