在商铺火灾中，若鉴定机构无法鉴定间接损失，法院会根据具体情况采取不同的处理方式。以下是从多个角度对此问题的详细分析：
法院可能依赖其他证据：
- 当鉴定机构无法直接鉴定间接损失时，法院并不会因此就无法作出裁决。法院会审查双方提供的所有证据，包括但不限于合同、发票、财务报表、证人证言等，以尝试确定间接损失的具体数额。例如，如果商铺因火灾无法营业，导致租金损失、员工工资损失等，这些损失可以通过相关合同和财务记录来证明。
法院可能采用合理推断：
- 在某些情况下，即使没有直接的鉴定报告，法院也可能根据已知事实和常识进行合理推断，以确定间接损失的范围和数额。例如，如果火灾导致商铺完全毁损，且该商铺之前一直处于正常营业状态，那么法院可能会根据该商铺的历史营业额、行业平均利润率等因素，合理推断出因火灾导致的营业损失。
法院可能要求补充鉴定或专家意见：
- 如果法院认为现有证据不足以确定间接损失，且鉴定机构无法直接提供鉴定报告，法院可能会要求双方补充提供其他证据，或者邀请相关领域的专家出具意见，以协助法院确定间接损失。这些专家可能包括会计师、经济师、行业专家等，他们可以从专业角度对间接损失进行评估和估算。
法院可能根据公平原则进行裁决：
- 在极端情况下，如果双方均无法提供充分证据证明间接损失的具体数额，且鉴定机构也无法给出明确意见，法院可能会根据公平原则进行裁决。这意味着法院会考虑双方的实际损失、过错程度、经济状况等因素，以尝试达成一个相对公平的裁决结果。然而，这种情况相对较少见，因为法院通常会尽力通过其他方式确定间接损失的具体数额。
法律建议：
- 对于商铺业主而言，在火灾发生后，应尽快收集并保存所有与间接损失相关的证据，包括合同、发票、财务报表、证人证言等。这些证据将有助于在后续的法律程序中证明自己的损失。
- 如果鉴定机构无法直接鉴定间接损失，商铺业主可以考虑寻求其他专业机构的帮助，如会计师事务所、经济咨询公司等，以获取更全面的损失评估报告。
- 在法律程序中，商铺业主应积极配合法院的工作，提供所有必要的证据和信息，以便法院能够准确、公正地裁决间接损失的问题。
可能法律后果：
- 如果商铺业主能够提供充分证据证明间接损失的具体数额，且法院认可这些证据，那么商铺业主将有可能获得相应的赔偿。
- 如果商铺业主无法提供充分证据证明间接损失，或者法院认为现有证据不足以支持商铺业主的赔偿请求，那么商铺业主可能无法获得全额赔偿，甚至可能无法获得任何赔偿。
希望以上分析能够对你有所帮助。如果你还有其他法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。