结论：网约车没有营运证出了事故，保险公司是否赔偿商业险需分情况讨论，主要取决于保险合同条款约定以及事故具体情况，以下为具体分析：

1. 保险合同条款有明确约定
   • 若条款明确将无营运证情形列为免责事由：在商业险保险合同中，保险公司通常会设置一系列免责条款。如果合同中明确且清晰地约定了“被保险车辆未取得营运证从事营运活动期间发生事故，保险公司不承担商业险赔偿责任”，那么在这种情况下，一旦网约车在没有营运证的情况下出了事故，保险公司有权依据该条款拒绝赔偿商业险。这是因为保险合同是双方自愿签订的具有法律效力的合同，双方都应当遵守合同约定。保险公司通过设置这样的免责条款，是为了控制风险，避免为非法营运行为提供保障。
   • 若条款未明确约定或约定不明确：如果保险合同中没有明确将无营运证情形列为免责事由，或者约定不够清晰明确，导致双方对条款的理解存在争议。在这种情况下，根据《中华人民共和国民法典》中关于合同解释的规定，应当倾向于保护被保险人的利益。一般来说，保险公司不能简单地以车辆无营运证为由拒绝赔偿商业险。此时，可能需要通过进一步的协商、调解或者诉讼等方式来确定保险公司是否应当承担赔偿责任。
2. 保险公司是否履行了明确说明义务
   • 已履行明确说明义务：根据《中华人民共和国保险法》的规定，保险公司对保险合同中的免责条款负有明确说明义务。如果保险公司能够提供充分的证据，证明在签订保险合同时，已经向投保人详细解释了免责条款的内容，包括无营运证出险不赔这一条款，并且投保人已经明确表示理解并同意。那么在这种情况下，当网约车无营运证出险时，保险公司可以依据该免责条款拒绝赔偿商业险。
   • 未履行明确说明义务：如果保险公司无法证明自己已经履行了明确说明义务，那么即使保险合同中有无营运证出险不赔的免责条款，该条款也可能不产生法律效力。因为投保人在签订保险合同时，可能并不清楚该免责条款的具体含义和后果。在这种情况下，保险公司不能以该免责条款为由拒绝赔偿商业险，而应当按照保险合同的约定承担赔偿责任。
3. 事故与无营运证之间的因果关系
   • 存在直接因果关系：如果网约车没有营运证这一违法行为与事故的发生存在直接的因果关系，例如因为车辆没有经过合法的营运检测，导致车辆存在安全隐患而引发事故。那么在这种情况下，保险公司可能会以车辆非法营运导致事故风险增加为由，拒绝赔偿商业险。因为保险保障的是合法、合规的风险，对于因违法行为导致的损失，保险公司有权拒绝承担赔偿责任。
   • 不存在直接因果关系：如果事故的发生与网约车没有营运证这一事实之间不存在直接的因果关系，例如事故是由于第三方闯红灯导致的，与车辆是否具有营运证无关。那么在这种情况下，保险公司不能简单地以车辆无营运证为由拒绝赔偿商业险。而应当根据事故的具体情况和保险合同的约定，确定是否应当承担赔偿责任。

建议：网约车司机在从事营运活动前，一定要确保车辆取得合法的营运证，并且仔细阅读保险合同的条款，了解保险公司的免责范围。如果对保险合同条款存在疑问，可以及时向保险公司咨询或者寻求专业法律人士的帮助。在发生事故后，要保留好相关证据，以便在需要时维护自己的合法权益。如果遇到保险公司拒赔的情况，可以通过协商、调解或者诉讼等方式解决纠纷。