针对您提出的“搅拌站违规生产由哪个政府部门处罚以及怎么处罚”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、处罚部门
搅拌站违规生产的处罚部门主要取决于违规的具体性质。一般来说，如果搅拌站涉及违法现场搅拌混凝土、砂浆或违法设置移动式搅拌站，这类行为通常由市（州）、县（市、区）人民政府的住房城乡建设行政主管部门或者城市管理行政执法部门负责处罚。如果搅拌站的违规行为涉及环境污染，如未报批环评审批手续擅自开工建设或未采取有效的扬尘污染防治措施，那么这类行为将由县级以上生态环境主管部门进行处罚。
二、处罚方式及依据
对于违法现场搅拌混凝土、砂浆或违法设置移动式搅拌站的行为：
- 处罚依据：《四川省散装水泥管理条例》等相关法规。
- 处罚方式：责令停止违法行为、限期改正，并处五万元以上十万元以下的罚款；拒不改正的，责令停止施工。
对于涉及环境污染的违规行为：
- 处罚依据：《中华人民共和国环境影响评价法》、《昭通市扬尘污染防治条例》等相关法规。
- 处罚方式：
- 未依法报批建设项目环境影响报告书、报告表擅自开工建设的，由县级以上生态环境主管部门责令停止建设，根据违法情节和危害后果，处建设项目总投资额百分之一以上百分之五以下的罚款，并可以责令恢复原状。
- 未采取有效扬尘污染防治措施的，由县级以上人民政府生态环境主管部门责令限期改正，处2万元以上10万元以下罚款；逾期不改正的，责令停工整治、停产整治或者停业整治。
三、处罚流程
无论哪种违规行为，处罚流程通常包括以下几个步骤：
- 立案：相关部门在发现违规行为后，会进行审查并决定是否立案。
- 调查：立案后，相关部门会指定专人负责调查取证，收集证据材料。
- 审查：对案件违法事实、证据、调查取证程序、法律适用等进行审查，提出处理意见。
- 告知：在作出行政处罚决定前，会制作《行政处罚事先告知书》送达当事人，告知其违法事实、处罚依据及享有的权利。
- 决定：制作《行政处罚决定书》，载明行政处罚内容、当事人陈述申辩或听证情况等。
- 送达：将行政处罚决定书按法律规定的方式送达当事人。
- 执行：当事人应依照生效的行政处罚决定履行义务，如逾期未履行，相关部门可依法强制执行或申请人民法院强制执行。
综上所述，搅拌站违规生产的处罚部门及处罚方式取决于违规的具体性质和相关法规的规定。如果您或您的企业遇到此类问题，建议及时咨询当地相关部门或专业律师以获取更具体的指导和帮助。