保密部门在发现违法行为后，可以采取的处置措施主要包括以下几个方面：

1. 内部调查与取证：

   • 保密部门应首先启动内部调查程序，对涉嫌违法的行为进行详细调查，包括收集相关证据、询问涉事人员等。
   • 调查过程中，应确保程序的合法性和正当性，避免侵犯员工的合法权益，如隐私权等。
   • 取证应全面、客观，确保证据的真实性和有效性，为后续处理提供坚实基础。

2. 根据违法性质采取相应措施：

   • 轻微违法：如果违法行为情节轻微，且未造成严重后果，保密部门可以考虑采取警告、记过等内部纪律处分措施，同时要求涉事人员立即停止违法行为，并承诺不再犯。
   • 严重违法：若违法行为情节严重，或已造成较大损失或不良影响，保密部门应及时向公司高层报告，并建议采取更严厉的措施，如解除劳动合同、追究法律责任等。
   • 涉嫌犯罪：如果违法行为涉嫌犯罪，保密部门应立即向公安机关报案，并配合公安机关的调查工作，提供必要的证据和协助。

3. 完善保密制度与培训：

   • 保密部门应借此机会对公司的保密制度进行全面审查和完善，确保制度的科学性和有效性。
   • 同时，加强员工的保密意识培训，提高员工对保密工作的重视程度和遵守保密规定的自觉性，从源头上减少违法行为的发生。

4. 后续监督与整改：

   • 在采取处置措施后，保密部门应持续对涉事部门或人员进行监督，确保违法行为得到彻底纠正，且不再发生类似问题。
   • 对于整改不力的部门或人员，保密部门应再次采取相应措施，直至问题得到彻底解决。

5. 法律合规性审查：

   • 在整个处置过程中，保密部门应确保所有措施均符合相关法律法规的规定，避免因处置不当而引发新的法律风险。
   • 如有必要，可咨询专业法律人士的意见，确保处置措施的合法性和合规性。

在采取上述措施时，保密部门还需注意以下几点：

• 保护员工权益：在调查和处理过程中，应尊重和保护员工的合法权益，避免过度侵犯或滥用权力。
• 及时沟通与反馈：与涉事部门或人员保持及时沟通，了解其想法和态度，同时向公司高层反馈处理进展和结果。
• 记录与存档：对调查过程、处理措施及结果等进行详细记录，并妥善存档，以备后续查阅和参考。

如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。