关于集体土地违法建设查处主体的问题，结论如下：
主要查处主体：
- 自然资源主管部门：根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，自然资源主管部门是集体土地违法建设的主要查处机关。它们负责监督土地的使用情况，对违反土地管理法律、法规的行为进行调查和处理。在集体土地上违法建设的情况下，自然资源主管部门有权责令停止建设、限期拆除，并可以处以罚款等行政处罚。
其他可能的查处主体：
- 乡镇人民政府：在特定情况下，乡镇人民政府也可能成为集体土地违法建设的查处主体。例如，根据《中华人民共和国城乡规划法》的规定，在乡、村庄规划区内进行违法建设的，由乡镇人民政府责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可以拆除。这表明，在涉及城乡规划的违法建设案件中，乡镇人民政府具有一定的查处权力。
- 城市管理综合行政执法部门：在一些地区，城市管理综合行政执法部门也可能负责查处集体土地上的违法建设。这通常取决于地方政府的授权和具体规定。这些部门通常具有较为广泛的执法权限，可以处理包括违法建设在内的多种城市管理问题。
查处主体的确定因素：
- 违法建设的性质：不同的违法建设性质可能涉及不同的查处主体。例如，如果违法建设涉及土地使用权的非法转让或占用，那么自然资源主管部门将是主要的查处机关；如果违法建设涉及城乡规划的违反，那么乡镇人民政府或城市管理综合行政执法部门可能成为查处主体。
- 地域因素：不同地区的政府机构设置和职责划分可能存在差异，因此查处主体也可能有所不同。在一些地区，可能由专门的土地执法队伍或城乡规划执法队伍负责查处集体土地上的违法建设。
法律建议：
- 如果您发现集体土地上存在违法建设行为，首先可以向当地的自然资源主管部门进行举报或投诉。他们是最主要的查处机关，具有专业的执法能力和资源。
- 如果违法建设行为涉及城乡规划的违反，您也可以考虑向乡镇人民政府或城市管理综合行政执法部门进行举报。他们可能根据具体情况进行查处。
- 在举报或投诉时，请尽量提供详细的违法建设信息，如地点、规模、建设时间等，以便查处机关能够迅速准确地定位和处理问题。
总结：集体土地违法建设的查处主体主要包括自然资源主管部门，以及在特定情况下的乡镇人民政府和城市管理综合行政执法部门。具体查处主体的确定取决于违法建设的性质和地域因素。如果您遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。