结论前置：公司以调休代替法定节假日的加班工资是违法的，这一行为违反了《中华人民共和国劳动法》的明确规定。

法律依据与解释：

1. 《中华人民共和国劳动法》第四十四条：

   • 该法条明确规定了三种不同情况下的工资支付标准，其中第三款特别指出：“法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。”这一规定直接否定了以调休代替法定节假日加班工资的可能性。

2. 法定节假日的特殊性质：

   • 法定节假日是法律赋予劳动者的特殊休息权利，具有不可替代性。这些节日不仅关乎劳动者的身体健康和精神文化生活，还涉及其参与社会活动的权利。因此，法律对法定节假日的加班工资支付有特别且严格的规定。

3. 调休与加班费的严格区分：

   • 在休息日加班的情况下，用人单位有权选择先安排调休，若无法调休则支付加班费。但在法定节假日加班的情况下，无论是否安排调休，用人单位都必须支付不低于工资300%的加班费。这是法律的强制性规定，用人单位必须遵守。

法律后果与维权建议：

• 法律后果：如果用人单位违反法律规定，以调休代替法定节假日的加班费支付，将构成对劳动者合法权益的侵犯。劳动者有权向劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁等法律途径来维护自己的合法权益，要求用人单位按照法律规定支付法定节假日加班的三倍工资。

• 维权建议：

  1. 保留证据：劳动者应保留好加班记录、工资条等证据，以便在维权时提供证明。
  2. 及时投诉：一旦发现用人单位存在违法行为，劳动者应及时向劳动监察部门投诉，或者向劳动仲裁机构申请仲裁。
  3. 寻求法律援助：在维权过程中，如果劳动者遇到法律难题或需要法律帮助，可以向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。

特殊情况说明：

• 尽管在极个别特殊行业或紧急情况下，可能存在灵活处理的方式，但这通常需要符合特定的条件和经过相关部门的批准。例如，涉及公共利益、国家安全等特殊行业，在紧急情况下可能需要安排劳动者在法定节假日工作。然而，这并不改变法定节假日加班应支付高额加班费的基本原则，且事后应根据实际情况进行综合协调处理。

综上所述，公司以调休代替法定节假日的加班工资是违法的，劳动者有权维护自己的合法权益。如果你或你身边的人遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。