在交通事故中，若对方车主被认定为全责，住院费原则上先由保险公司在责任限额内进行赔偿；若保险赔偿不足，则由肇事司机承担剩余部分的赔偿责任。以下是具体分析：
保险公司的赔偿责任：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条，机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，由保险公司在机动车第三者责任强制保险责任限额范围内予以赔偿。这意味着，如果对方车主购买了交强险，那么住院费等医疗费用将首先由保险公司在交强险的医疗费用赔偿限额内进行赔付。
- 如果对方车主还购买了商业第三者责任险，且住院费等损失超出了交强险的赔偿限额，那么超出部分将由保险公司在商业第三者责任险的赔偿限额内继续赔付。
肇事司机的赔偿责任：
- 如果住院费等损失超出了保险公司所有险种的赔偿限额，或者对方车主未购买相应的保险，那么剩余的赔偿责任将由肇事司机承担。
- 此外，如果肇事司机存在故意或重大过失，导致保险公司拒绝赔偿或赔偿不足，那么肇事司机也需要承担相应的赔偿责任。
建议：
- 在处理此类事故时，建议及时报警并保留好相关证据，如医疗记录、费用清单、交通事故认定书等，以便在后续理赔过程中提供有力支持。
- 如果对保险公司的赔偿方案有异议，或者肇事司机拒绝承担赔偿责任，可以寻求法律援助或通过诉讼途径维护自己的合法权益。
在处理交通事故赔偿问题时，请务必保持冷静，依法维权。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。