分居证明一式三份，通常每一份都需要盖章。以下是详细解释：

1. 证明文件的效力：分居证明作为法律文件，其每一份都应具有独立的法律效力。盖章是确认文件真实性和有效性的重要方式，因此每一份分居证明上加盖公章或相关印章，可以确保每一份文件都具有同等的法律效力。

2. 使用场景的多样性：分居证明可能需要在不同的场合或机构使用，如法院、婚姻登记机关、户籍管理部门等。如果只有一份盖章的原件，而其他两份是复印件或未盖章的版本，那么在某些情况下，复印件或未盖章的版本可能不被接受或认可。因此，为了确保分居证明在各种场合下都能被顺利接受和使用，每一份都需要盖章。

3. 避免后续纠纷：如果分居证明只有一份盖章的原件，而其他两份未盖章，那么在未来可能出现的法律纠纷中，未盖章的版本可能会引发争议或不被采纳。为了避免这种情况的发生，最好在每一份分居证明上都加盖公章或相关印章。

建议：在准备分居证明时，最好一次性准备三份（或更多，根据需要）都盖章的原件。这样不仅可以确保每一份文件都具有法律效力，还可以避免因文件缺失或不被接受而带来的不必要的麻烦和损失。如果还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。