公交车辆跨省自用是否合法，需根据具体情况判断，一般而言，若符合相关规定并办理必要手续，则是合法的。以下从不同角度进行分析：
车辆性质与用途：
- 公交车辆通常设计用于公共交通服务，即搭载多名乘客进行固定路线的运输。若车辆性质未改变，且仍用于公共交通服务，则跨省运营需遵守相关公共交通运营规定，包括线路审批、运营许可等。
- 若公交车辆被改为自用，即仅用于个人或特定团体的非商业运输，且车辆性质已相应变更（如从营运车辆变为非营运车辆），则需确保车辆符合自用车辆的相关标准，并办理必要的手续。
跨省运营的手续：
- 无论车辆性质如何，若计划跨省运营（即使是自用），都需了解并遵守目标省份的交通管理规定。这可能包括车辆年检、保险、环保标准等方面的要求。
- 对于自用车辆，虽然可能不需要像营运车辆那样严格的审批流程，但仍需确保车辆符合上路标准，并办理必要的跨省通行手续（如临时通行证等，具体取决于地方规定）。
法律后果：
- 若未遵守相关规定，擅自跨省运营公交车辆（无论是商用还是自用），都可能面临法律处罚，包括但不限于罚款、扣留车辆等。
- 对于自用车辆，若因未办理必要手续或违反交通管理规定而被查处，同样会面临相应的法律后果。
建议：
- 在计划跨省自用公交车辆前，务必了解并遵守相关法律法规和地方规定。
- 咨询当地交通管理部门或专业律师，以获取更具体和准确的指导。
- 确保车辆符合所有上路标准，并办理必要的跨省通行手续。
如有任何进一步的问题或需要更详细的法律咨询，请直接向我提问，我会根据你的具体情况提供更专业的解答。