履约保证金逾期未退的违约金计算，需根据合同约定、法律规定及实际损失情况综合判断，具体分析如下：

1. 合同有明确约定时
   若合同中明确约定了“履约保证金逾期退还的违约金计算方式”（如按日万分之五计算、固定金额等），则优先适用合同约定。但需注意：

   • 违约金不得过分高于实际损失（通常不超过损失的30%），否则对方可能请求法院或仲裁机构调整；
     
   • 若合同约定过高或过低，可结合实际损失（如资金占用利息、再融资成本等）主张调整。
     

2. 合同无约定或约定不明时
   若合同未约定违约金，可依据《民法典》第584条主张“实际损失赔偿”，常见计算方式包括：

   • 资金占用利息：按LPR（全国银行间同业拆借中心公布的贷款市场报价利率）计算逾期期间的利息；
     
   • 其他直接损失：如因保证金未退还导致的额外费用（如诉讼费、律师费等，需合同或法律明确支持）。
     

3. 对方主张免责或减责时
   若对方以“不可抗力”“合同未到期”等理由拒绝退还或要求减少违约金，需审查：

   • 不可抗力是否成立（如自然灾害、政府行为等）；
     
   • 对方是否已履行通知义务并采取减损措施；
     
   • 合同是否约定免责条款及其效力。
     

建议行动步骤：

1. 核对合同条款，确认违约金约定及退还条件；
   
2. 收集证据（如保证金支付凭证、催告记录、实际损失证明）；
   
3. 优先与对方协商，明确退还时间及违约金金额；
   
4. 若协商无果，可向法院起诉或申请仲裁，主张违约金及实际损失。
   

如有具体合同条款或案件细节，可进一步向我咨询，我会结合实际情况为您详细分析。