兄妹三人共同继承父母财产的协议是可以进行公证的，但必须遵循法定程序，在公证处由专业公证员进行，不能私下办理。以下从多个角度对此问题进行详细分析：

公证的必要性

在兄妹三人共同继承父母财产的过程中，公证是一个重要的法律环节。它能够帮助明确继承人的身份、继承份额以及财产的归属，从而有效避免后续的纠纷。通过公证，可以确保继承协议的合法性和有效性，为继承人提供法律保障。

公证的流程

1. 准备材料：继承人需要准备被继承人的死亡证明、继承协议原件、继承人的身份证明以及与被继承人的亲属关系证明等材料。
2. 提交申请：继承人需要前往当地的公证处提交公证申请，并填写相关的申请表。
3. 缴纳费用：根据公证处的规定，继承人需要缴纳一定的公证费用。
4. 审核材料：公证员会对提交的材料进行严格审核，确保继承协议的真实性和合法性。
5. 出具公证书：审核通过后，公证处会出具公证书，证明继承协议的合法性和有效性。

公证的注意事项

1. 遵循法定程序：公证必须遵循法律规定的程序和要求，不能私下进行。继承人应该前往当地的公证处进行咨询和申请，而不是尝试私下进行所谓的“公证”。
2. 确保材料真实：继承人需要确保提交的材料真实、完整、有效。如果材料存在虚假或遗漏，可能会导致公证无效或引发后续纠纷。
3. 明确继承份额：在继承协议中，继承人应该明确各自的继承份额和权益，以避免后续因份额不清而引发的纠纷。

特殊情况下的公证

1. 遗嘱继承：如果父母生前已经立下了遗嘱，并且明确指定了财产的继承人，那么在父母去世后，这份遗嘱将成为处理财产继承的重要依据。为了确保遗嘱的法律效力，继承人通常需要前往公证处对遗嘱进行公证。
2. 法定继承：如果父母没有留下遗嘱，或者遗嘱中没有明确指定财产的继承人，那么根据法定继承的规定，兄妹作为第一顺序的继承人之一，有权继承父母的财产。在这种情况下，为了明确各自的继承份额和权益，兄妹之间可以协商后进行公证。

法律后果

如果继承人未按照法定程序进行公证，或者提交的材料存在虚假或遗漏，可能会导致公证无效或引发后续纠纷。在极端情况下，甚至可能涉及法律责任。因此，继承人应该高度重视公证的合法性和有效性，确保自己的权益得到法律保障。

综上所述，兄妹三人共同继承父母财产的协议是可以进行公证的，但必须遵循法定程序和要求。如果你在继承过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。