对在民政局办理的离婚协议有异议，是可以起诉的，并且确实存在时间限制。以下是对这一问题的详细分析：
一、可以起诉的情况
协议内容存在欺诈、胁迫：
- 如果一方在签订离婚协议时存在欺诈、胁迫等情形，导致另一方在违背真实意愿的情况下签订了协议，那么受欺诈、胁迫的一方有权向法院提起诉讼，请求撤销或变更离婚协议。
协议内容显失公平：
- 如果离婚协议中的财产分割、子女抚养等条款显失公平，即一方明显受益而另一方明显受损，且这种不公平并非出于双方自愿，那么受损方也有权向法院提起诉讼，请求重新分割财产或调整子女抚养等条款。
协议未履行或履行不完全：
- 如果一方未按照离婚协议的约定履行义务，如未支付抚养费、未分割财产等，另一方有权向法院提起诉讼，要求对方履行协议或承担违约责任。
二、时间限制
撤销权行使期限：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，因欺诈、胁迫等情形导致离婚协议可撤销的，受欺诈、胁迫方应当自知道或者应当知道撤销事由之日起一年内行使撤销权。逾期未行使的，撤销权消灭。
诉讼时效：
- 对于因离婚协议产生的其他纠纷，如财产分割、子女抚养等，如果一方认为自己的权益受到侵害，应当在知道或应当知道权益受到侵害之日起三年内向法院提起诉讼。这是根据《中华人民共和国民法典》中关于诉讼时效的规定。
三、实际操作建议
及时咨询律师：
- 如果你对离婚协议有异议，建议尽快咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的法律后果。
收集证据：
- 在提起诉讼前，务必收集好相关证据，如离婚协议、沟通记录、转账记录等，以证明自己的主张。
注意时间限制：
- 密切关注上述时间限制，确保在法定期限内行使权利或提起诉讼，以免丧失胜诉权。
举例说明：假设甲和乙在民政局办理了离婚手续，并签订了离婚协议。后来，甲发现乙在签订协议时存在欺诈行为，导致甲在财产分割上遭受了重大损失。甲应当在知道或应当知道欺诈事由之日起一年内，向法院提起诉讼，请求撤销或变更离婚协议中的财产分割条款。如果甲逾期未行使撤销权，则撤销权消灭，甲将无法再通过法律途径维护自己的权益。
总结来说，对在民政局办理的离婚协议有异议是可以起诉的，但需要注意时间限制。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。