结论：针对您提出的“三年前骗我五千现还一千不再还，还能告诈骗吗”这一问题，从民事角度，您仍有权通过法律途径追讨剩余的4000元债务；从刑事角度，由于时间已过三年且部分还款，直接以诈骗罪起诉的难度较大，但并非完全不可能，需结合具体证据和情况判断。以下从民事和刑事两个角度为您详细分析：
民事角度
债务关系依然存在：
- 尽管对方已经归还了1000元，但剩余的4000元债务依然存在。您有权要求对方继续履行还款义务。
- 您可以向法院提起民事诉讼，要求对方归还剩余的4000元债务。在诉讼过程中，您需要提供相关证据，如转账记录、聊天记录等，以证明债务关系的存在和对方未完全履行还款义务的事实。
诉讼时效问题：
- 根据《中华人民共和国民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。但诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
- 在您的情况下，如果对方在三年前骗取了您的钱财，并且您一直不知道或无法知道对方不会继续还款，那么诉讼时效可能并未开始计算，或者已经因为您的积极追讨（如要求还款、协商等）而中断并重新计算。
- 因此，从民事诉讼的角度来看，您仍然有可能在诉讼时效期内提起诉讼。
刑事角度
诈骗罪的构成要件：
- 诈骗罪是指以非法占有为目的，用虚构事实或者隐瞒真相的方法，骗取数额较大的公私财物的行为。
- 在您的情况下，如果对方确实以非法占有为目的，通过虚构事实或隐瞒真相的方式骗取了您的5000元，并且至今未归还剩余的4000元，那么对方的行为可能构成诈骗罪。
起诉的难度：
- 然而，由于时间已经过去三年，并且对方已经归还了部分款项，这可能会增加起诉的难度。
- 公安机关在立案时，会综合考虑多种因素，包括证据的充分性、犯罪行为的严重性、社会危害性等。如果证据不足或犯罪行为情节轻微，公安机关可能不会立案。
- 此外，即使公安机关立案并侦查终结，检察院在审查起诉时也可能因为证据不足或情节轻微而作出不起诉决定。
建议：
- 如果您认为对方的行为构成诈骗罪，并且您有足够的证据支持您的主张，那么您可以向当地公安机关报案。
- 在报案时，您需要提供详细的证据材料，如转账记录、聊天记录、证人证言等，以证明对方的行为构成诈骗罪。
- 同时，您也可以考虑咨询专业律师的意见，以便更好地了解您的权利和义务，以及如何更有效地维护您的合法权益。
总结与建议：从民事角度来看，您仍然有权通过法律途径追讨剩余的4000元债务；从刑事角度来看，虽然直接以诈骗罪起诉的难度较大，但并非完全不可能。我建议您先尝试通过民事诉讼途径解决债务问题，如果民事诉讼无法解决问题，再考虑是否向公安机关报案。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。