针对您提出的“项目结束后发现围标怎么办以及是否应付款”的问题，这确实是一个涉及法律、合规及项目管理的复杂议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、围标行为的性质与后果
围标，即串通投标，是一种违法行为，它破坏了公平竞争的市场环境，损害了其他投标人的合法权益，也可能对项目质量、进度和成本产生负面影响。根据《中华人民共和国政府采购法》及相关法律法规，围标行为一旦查实，将面临严厉的行政处罚，包括但不限于罚款、列入不良行为记录名单、禁止参加政府采购活动等，情节严重的还可能构成犯罪，依法追究刑事责任。
二、项目结束后发现围标的处理方式
调查核实：
- 首先，应立即对围标行为进行调查核实，收集相关证据，如投标文件、通信记录、资金往来等，以确认围标事实的存在。
报告相关部门：
- 将调查结果报告给项目的主管部门或监管机构，如财政部门、采购中心等，以便他们根据法律法规进行进一步处理。
法律追责：
- 根据调查结果和法律法规，对参与围标的供应商进行法律追责，包括行政处罚和可能的刑事处罚。
项目处理：
- 对于已经结束的项目，如果围标行为对项目结果产生了实质性影响，可能需要重新评估项目结果，甚至考虑重新招标或采取其他补救措施。
三、关于是否应付款的问题
合同效力：
- 如果围标行为被查实，且该行为对合同签订产生了实质性影响（如通过不正当手段中标），则合同可能因违法而无效或可撤销。
付款决策：
- 在合同无效或可撤销的情况下，付款决策应基于合同的实际履行情况、法律法规的规定以及项目主管部门的意见。
- 如果合同尚未履行或部分履行，且围标行为导致合同无法继续履行或履行将违反法律法规，则不应继续付款。
- 如果合同已经履行完毕，但围标行为对项目结果产生了负面影响，可能需要通过法律途径解决付款问题，如要求供应商返还已支付的款项或赔偿损失。
合规建议：
- 在未来项目中，应加强投标文件的审核和投标过程的监督，确保投标活动的公平、公正和透明。
- 建立完善的供应商管理制度，对供应商的资质、信誉和业绩进行全面评估，降低围标风险。
四、特殊情况考虑
- 行政处罚追责期限：根据《中华人民共和国行政处罚法》，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚（涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，追责期限延长至五年）。因此，在处理围标行为时，需考虑追责期限的问题。
- 刑事责任追诉期限：如果围标行为构成犯罪，还需考虑刑事责任的追诉期限。根据《刑法》的相关规定，法定最高刑为不满五年有期徒刑的，经过五年不再追诉。
综上所述，项目结束后发现围标行为，应立即进行调查核实并报告相关部门，根据法律法规进行法律追责，并谨慎处理付款问题。同时，建议加强未来项目的合规管理，降低围标风险。