村干部未经合法程序为1000亩小麦投保且由保险公司兜底的行为，可能涉及行政违法、民事无效及保险诈骗风险，具体需结合操作细节判断。以下从法律角度分情况详细说明：

一、若村干部未经村民会议或村民代表会议同意，擅自以集体名义投保

1. 行政违法风险
   根据《村民委员会组织法》第24条，涉及村民利益的重大事项（如集体财产处置）需经村民会议或代表会议讨论决定。若村干部未履行民主议定程序，擅自投保1000亩小麦，可能被认定为“越权代理”，乡镇政府可责令改正或启动罢免程序。

2. 保险合同效力风险
   若投保时未提供真实土地权属证明（如承包合同、流转协议），或虚构投保面积，保险公司可依据《保险法》第16条主张合同因“欺诈”或“重大误解”而无效，拒绝赔付并追回已支付款项。

二、若保险公司明知投保程序违法仍承诺兜底

1. 保险合同无效风险
   根据《民法典》第154条，若保险公司与村干部恶意串通（如明知无合法授权仍承保），合同自始无效，双方需返还财产，保险公司可能因“过错”承担赔偿责任。

2. 行政处罚风险
   保险公司若存在“未严格审核投保材料”“违规承诺兜底”等行为，可能违反《农业保险条例》第27条，被银保监会处以罚款、责令停业整顿或吊销业务许可证。

三、若涉及虚构投保面积或骗取补贴

1. 刑事犯罪风险
   若村干部与保险公司合谋虚构1000亩投保面积，以骗取国家财政补贴（如农业保险保费补贴），可能构成《刑法》第266条的诈骗罪，数额较大的（通常3000元以上）可处三年以下有期徒刑。

2. 个人责任风险
   村干部作为直接责任人，需承担刑事责任；若保险公司工作人员参与，则构成共同犯罪，均需依法追责。

操作建议

1. 立即补正程序：若投保行为已发生，应尽快召开村民会议补签授权文件，完善土地权属证明。
2. 自查合同条款：核对保险合同中“投保人资格”“保险标的”等条款，确保与实际情况一致。
3. 咨询监管部门：向当地银保监分局或农业农村局报告情况，主动说明问题以降低处罚风险。

提示：农业保险涉及集体利益和国家补贴，操作需严格依法合规。若您是村干部或村民，对具体操作细节有疑问，可直接向我提供更多信息（如投保流程、资金来源等），我会进一步分析风险点。