您好，关于汽车更换发动机是否合法的问题，我可以给您详细解答。

汽车更换发动机本身是合法的，但前提是必须按照相关规定办理变更登记手续。根据《中华人民共和国道路交通安全法》以及《机动车登记规定》的相关条款，机动车在更换发动机后，机动车所有人需要在变更后十日内向车辆管理所申请变更登记。

申请变更登记时，您需要准备以下材料：

1. 机动车所有人的身份证明；
2. 机动车登记证书；
3. 机动车行驶证；
4. 机动车安全技术检验合格证明。

办理程序如下：

1. 您需要将上述材料准备齐全，并前往机动车登记地的车辆管理所；
2. 车辆管理所会在受理之日起一日内，确认机动车，并审查您提交的证明、凭证；
3. 如果审查通过，车辆管理所会在机动车登记证书上签注变更事项，收回原有的行驶证，并重新核发行驶证。

需要注意的是，有以下情形之一的，车辆管理所将不予办理变更登记：

1. 改变机动车的品牌、型号和发动机型号的（但经国务院机动车产品主管部门许可选装的发动机除外）；
2. 改变已登记的机动车外形和有关技术数据的（但法律、法规和国家强制性标准另有规定的除外）；
3. 机动车所有人提交的证明、凭证无效的；
4. 机动车达到国家规定的强制报废标准的；
5. 机动车被人民法院、人民检察院、行政执法部门依法查封、扣押的；
6. 机动车属于被盗抢的。

另外，如果更换发动机后需要改变机动车号牌号码，车辆管理所会收回原有的号牌和行驶证，确定新的机动车号牌号码，并重新核发号牌、行驶证和检验合格标志。

办理期限：自受理申请之日起1日内完成变更登记。

办理单位：机动车登记地公安机关交通管理部门车辆管理所。

收费标准：会按照《国家发展改革委 财政部关于加强和规范机动车牌证工本费等收费标准管理有关问题的通知》来执行。

综上所述，只要您按照相关规定办理变更登记手续，汽车更换发动机就是合法的。希望这个解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。