将经鉴定为D级危房的房屋出租，违法所得一般由县级以上地方人民政府房地产管理部门没收。以下是对此问题的详细分析：

法律依据

根据《商品房屋租赁管理办法》的相关规定，不符合安全、防灾等工程建设强制性标准的房屋不得出租。D级危房，根据相关规定，通常指的是承重结构已不能满足正常使用要求，房屋整体出现险情，构成整幢危房的情形。因此，将D级危房出租明显违反了上述规定。

没收主体

对于违法出租D级危房的行为，县级以上地方人民政府房地产管理部门是负责查处的主体。他们有权对违法行为进行调查取证，并根据违法情节的轻重，作出相应的行政处罚，包括没收违法所得。

法律后果

1. 没收违法所得：这是针对违法出租行为的一种经济处罚，旨在剥夺违法行为人因违法行为所获得的利益。
2. 罚款：除了没收违法所得外，房地产管理部门还可能对违法行为人处以罚款，罚款的数额通常根据违法情节的轻重和违法所得的多少来确定。
3. 其他法律责任：如果违法出租行为造成了严重后果，如房屋倒塌、人员伤亡等，违法行为人还可能承担刑事责任或民事赔偿责任。

实际操作建议

1. 立即停止出租：如果房屋被鉴定为D级危房，房东应立即停止出租行为，并通知承租人搬离，以确保人员安全。
2. 配合调查：如果房地产管理部门对违法出租行为进行调查，房东应积极配合，提供相关证据和资料。
3. 寻求法律帮助：如果房东对处罚决定有异议，可以在法定期限内申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。

特殊情况说明

如果房东在出租前并不知道房屋是D级危房，且能够提供相关证据证明自己的无过错，那么在处罚时可能会考虑这一因素，减轻或免除部分责任。但无论如何，确保房屋的安全是房东的基本责任，房东应定期对房屋进行安全检查，及时发现并处理安全隐患。

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