结论：在公司正在进入拍卖程序的情况下，债权人一般不可以直接申请支付令，但存在特殊情形。以下分情况详细说明：
根据《中华人民共和国民事诉讼法》第二百二十一条规定，债权人请求债务人给付金钱、有价证券，符合下列条件的，可以向有管辖权的基层人民法院申请支付令：
然而，当公司正在进入拍卖程序时，通常意味着公司已经出现了严重的财务困境，可能涉及多起债务纠纷，且公司的财产可能已被查封、冻结或正在被评估、拍卖。在这种情况下，很难满足支付令申请条件中“债权人与债务人没有其他债务纠纷”这一关键要求。因为进入拍卖程序的公司往往存在多个债权人，且债务关系复杂，不符合支付令的单一债权债务关系要求。
尽管一般情况下债权人不能在公司进入拍卖程序时直接申请支付令，但也存在一些特殊情形。例如，如果债权人在公司进入拍卖程序前已经获得了有效的法律文书（如判决书、裁定书等），并且该法律文书已经生效且未被撤销或变更，那么债权人可以依据这些法律文书向法院申请强制执行，包括参与拍卖程序以实现其债权。在这种情况下，虽然不是直接申请支付令，但债权人仍然有机会通过法律途径追讨债务。
另外，如果公司在进入拍卖程序前，与某个债权人达成了和解协议或调解协议，并且该协议已经生效且公司未履行，那么该债权人也可以依据协议内容向法院申请强制执行，包括申请支付令（如果符合支付令的申请条件）。但这种情况较为特殊，且需要满足一系列严格的条件。