农村房屋转让中，别人代签是否合法需分情况讨论，具体如下：
代签行为有合法授权时：
- 若房屋所有权人明确授权他人代为签署转让协议，且该授权行为合法有效（如书面授权委托书），则代签行为是合法的。在此情况下，代签人作为房屋所有权人的代理人，其签署的转让协议对房屋所有权人具有法律约束力。
代签行为无合法授权时：
- 若代签人未经房屋所有权人授权或授权不明确，擅自代为签署转让协议，则该代签行为可能构成无权代理。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，无权代理行为未经被代理人追认的，对被代理人不发生效力。在此情况下，房屋所有权人有权拒绝承认该转让协议的效力，并可能因此追究代签人的法律责任。
农村房屋转让的合法性还需考虑其他因素：
房屋产权的合法性：
- 农村房屋转让前，需确保房屋产权清晰，无争议。若房屋存在产权纠纷或未取得合法产权证明，则转让行为可能因违反法律法规而无效。
受让人的资格：
- 根据相关法律法规，农村房屋的受让人通常需为本集体经济组织成员。若受让人不符合这一资格要求，则转让行为可能因违反法律法规而无效。
转让程序的合法性：
- 农村房屋转让需遵循一定的程序，如签订书面转让协议、办理产权变更登记等。若转让程序存在瑕疵或未依法进行，则可能影响转让行为的合法性。
法律建议：
确保代签行为的合法性：
- 若需他人代为签署农村房屋转让协议，务必确保代签人获得合法授权，并保留好相关授权证明文件。
审查房屋产权和受让人资格：
- 在进行农村房屋转让前，务必审查房屋产权的合法性和受让人的资格要求，确保转让行为符合法律法规的规定。
遵循转让程序：
- 严格按照法律法规规定的程序进行农村房屋转让，包括签订书面转让协议、办理产权变更登记等，以确保转让行为的合法性和有效性。
可能面临的法律后果：
- 若农村房屋转让行为因代签行为无合法授权、房屋产权存在争议、受让人资格不符合要求或转让程序存在瑕疵而无效，则双方可能需承担返还财产、赔偿损失等法律责任。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。