结论：在民事案件一审、二审、再审后发现被告主要证据系伪造且有司法鉴定报告的情况下，一般不能重新起诉，但可以依法申请再审。
分析说明：
重新起诉的限制：
- 根据民事诉讼法的相关规定，民事案件的审理遵循“一事不再理”原则，即对于已经发生法律效力的判决、裁定，当事人不得就同一事实和理由再次提起诉讼。因此，在本案已经经过一审、二审、再审程序后，一般情况下，当事人不能就同一案件重新起诉。
申请再审的途径：
- 如果当事人发现被告的主要证据系伪造，并且有司法鉴定报告作为证据，这构成了新的证据，足以推翻原判决、裁定的，当事人可以在法定期限内（一般为判决、裁定发生法律效力后六个月内）向上一级人民法院申请再审。
- 申请再审时，当事人需要提交再审申请书，并附上相关证据材料，包括司法鉴定报告等，以证明原判决、裁定存在错误。
再审审查与处理：
- 人民法院在收到再审申请后，会进行审查，认为符合再审条件的，会裁定再审；认为不符合再审条件的，会裁定驳回申请。
- 如果裁定再审，人民法院会另行组成合议庭，按照审判监督程序对案件进行重新审理。在审理过程中，如果确认被告的主要证据系伪造，人民法院会依法改判或者撤销原判决、裁定，并作出新的判决、裁定。
特殊场景：
- 如果当事人在一审、二审、再审过程中均未能发现被告主要证据系伪造，或者虽然发现但未能及时提出有效证据进行反驳，导致案件结果不利，那么在发现新证据（如司法鉴定报告）后，及时申请再审是维护自身合法权益的有效途径。
行动建议：
- 当事人应尽快收集并整理相关证据材料，包括司法鉴定报告等，以证明被告主要证据系伪造。
- 在法定期限内向上一级人民法院提交再审申请书及相关证据材料，申请再审。
- 在再审过程中，积极配合人民法院的审理工作，提供必要的证据和陈述，以维护自身合法权益。
法律依据：
- 《中华人民共和国民事诉讼法》第二百零七条：“当事人的申请符合下列情形之一的，人民法院应当再审：……（五）对审理案件需要的主要证据，当事人因客观原因不能自行收集，书面申请人民法院调查收集，人民法院未调查收集的；（六）原判决、裁定认定事实的主要证据是伪造的；……”。
- 《中华人民共和国民事诉讼法》第二百一十二条：“当事人申请再审的，应当提交再审申请书等材料。人民法院应当自收到再审申请书之日起五日内将再审申请书副本发送对方当事人。对方当事人应当自收到再审申请书副本之日起十五日内提交书面意见；不提交书面意见的，不影响人民法院审查。人民法院可以要求申请人和对方当事人补充有关材料，询问有关事项”。