结论：员工对延时加班主动申请调休，公司是否需要支付加班费，这主要取决于调休是否已经实际安排并得到员工的确认，以及当地的劳动法规或公司规章制度的具体规定。在一般情况下，如果调休已经得到妥善安排，公司通常不需要额外支付加班费；但如果调休未能安排或不符合规定，公司则可能需要支付。
分析说明：
调休安排与加班费支付的关系：
- 根据《劳动法》及相关规定，员工在延时加班后，有权选择获得加班费或者进行调休。如果员工主动申请调休，并且公司已经实际安排了调休，且调休时间与加班时间相对应，那么在这种情况下，公司通常不需要再额外支付加班费。
- 然而，如果公司未能按照员工的申请安排调休，或者调休时间不足以抵消加班时间，那么公司可能需要支付相应的加班费。
当地劳动法规或公司规章制度的影响：
- 不同地区的劳动法规可能对加班费和调休有具体的规定。例如，有些地区可能明确规定了加班费和调休的转换比例，或者对调休的安排有特定的要求。
- 公司内部的规章制度也可能对加班费和调休有详细的规定。如果公司规章制度中明确规定了员工在延时加班后选择调休则不支付加班费，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司可以依据该规定执行。
实际操作中的注意事项：
- 在实际操作中，公司应确保调休安排的合理性和合法性，避免侵犯员工的合法权益。例如，调休时间应与加班时间相对应，且不应影响员工的正常休息和休假权益。
- 公司还应与员工就调休安排进行充分沟通，确保员工对调休安排有明确的了解并予以确认。这有助于减少因调休安排不当而引发的劳动争议。
法律建议：
- 对于公司而言，建议制定明确的加班和调休政策，并在员工入职时进行充分告知和培训。同时，公司应建立完善的加班和调休记录制度，以便在需要时提供证据支持。
- 对于员工而言，如果公司未能按照申请安排调休或者调休安排不合理，员工有权向公司提出异议并要求支付加班费。如果公司拒绝支付或未能妥善解决争议，员工可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
可能后果：
- 如果公司未能按照法律法规或公司规章制度的规定支付加班费或安排调休，可能会面临劳动监察部门的处罚或员工的法律诉讼。这不仅会给公司带来经济损失，还可能影响公司的声誉和员工关系。
- 对于员工而言，如果未能及时获得加班费或合理的调休安排，可能会影响其工作积极性和生活质量。因此，员工应积极维护自己的合法权益，及时与公司沟通并寻求解决方案。