针对第三方服务机构计算企业年排放量作假的行为，处罚措施需根据其具体违法情形、造成的后果以及相关法律规定综合判定，主要涉及行政处罚、刑事处罚及民事赔偿三个层面。具体分析如下：

1. 行政处罚
   根据《中华人民共和国大气污染防治法》《中华人民共和国环境保护法》等相关法律法规，第三方服务机构若在排放量核算过程中存在伪造数据、隐瞒真实情况等违法行为，生态环境主管部门可对其采取以下措施：

   • 没收违法所得：对机构通过作假行为获取的收益予以没收；
     
   • 罚款：根据违法情节轻重，处以罚款（具体金额需结合地方性法规及案件实际情况，如《大气污染防治法》规定可处所收费用一倍以上三倍以下罚款）；
     
   • 责令停业整顿：对情节严重的机构，可责令其停业整顿，直至符合资质要求；
     
   • 吊销资质：若作假行为导致严重环境后果，可吊销其相关环境服务资质证书；
     
   • 列入不良记录名单：将机构及责任人员纳入环境信用“黑名单”，实施联合惩戒。

2. 刑事处罚
   若第三方服务机构的作假行为构成犯罪（如提供虚假证明文件罪、出具证明文件重大失实罪），司法机关将依法追究刑事责任：

   • 提供虚假证明文件罪（《刑法》第二百二十九条）：
     若机构故意提供虚假的排放量核算报告，情节严重的，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员处五年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；
     若存在“索取他人财物或者非法收受他人财物”等加重情节，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
     
   • 出具证明文件重大失实罪：
     若机构因严重不负责任导致排放量核算报告存在重大失实，造成严重后果的，对直接责任人员处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。

3. 民事赔偿
   若企业因第三方服务机构的作假行为遭受损失（如因排放数据不实被行政处罚、停产整顿等），可依据《民法典》相关规定，要求机构承担民事赔偿责任，包括直接经济损失及合理维权费用。

建议：

• 对企业而言，应选择具备合法资质、信誉良好的第三方机构进行排放量核算，并定期复核数据真实性；
  
• 对第三方机构而言，需严格遵守环境监测技术规范，确保数据真实、准确，避免因违法违规行为承担法律责任；
  
• 若发现机构存在作假行为，可向生态环境主管部门举报，或通过法律途径追究其责任。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律适用及维权策略。