结论：在老公作为承包方，手下员工因未签劳动合同而起诉公司的情况下，一般不会直接查妻子的财产，但存在特定情形下可能间接涉及妻子财产的情况。以下从不同角度进行详细分析：
一、一般情况：不会直接查妻子财产
法律主体独立性：
- 公司作为独立的法人实体，其民事责任应由公司自身承担。员工因未签劳动合同起诉公司，主要是要求公司承担相应的法律责任，如支付双倍工资、补缴社保等。
- 妻子的财产，除非与公司财产存在混同或被用于公司经营等特定情况，否则与公司承担的法律责任无直接关联。
诉讼程序限制：
- 在民事诉讼中，法院的调查范围通常限于与案件直接相关的证据和事实。员工起诉公司，法院主要会调查公司的用工情况、劳动合同签订情况等，而不会直接调查公司股东或相关人员的个人财产。
二、特定情形：可能间接涉及妻子财产
公司财产与个人财产混同：
- 如果老公作为承包方，将公司财产与个人财产（包括妻子财产）混同使用，如将公司资金转入个人账户、用公司资产为个人债务提供担保等，那么在公司承担法律责任时，可能面临公司财产不足以清偿债务的情况。
- 在此情况下，债权人（如员工）可能通过法律途径追索公司股东或相关人员的个人财产，以弥补公司财产的不足。但这一过程需要债权人提供充分证据证明财产混同的存在。
妻子作为共同债务人：
- 如果老公因公司事务产生的债务被认定为夫妻共同债务（如债务用于家庭共同生活、共同生产经营等），那么妻子作为共同债务人，其财产可能面临被执行的风险。
- 但需要注意的是，夫妻共同债务的认定需要满足一定条件，并非所有公司债务都会自动视为夫妻共同债务。
三、法律建议
完善公司治理结构：
- 作为承包方，应确保公司具备独立的法人地位，完善公司治理结构，避免公司财产与个人财产混同。
- 及时与员工签订劳动合同，遵守劳动法律法规，减少劳动纠纷的发生。
谨慎处理夫妻共同财产：
- 在涉及公司事务时，应谨慎处理夫妻共同财产，避免将公司债务与个人债务混淆。
- 如需使用个人财产为公司提供担保或进行其他法律行为，应事先咨询专业律师，确保合法合规。
积极应对诉讼：
- 如员工已起诉公司，应积极应对诉讼，提供充分证据证明公司已履行相关法律义务（如已签订劳动合同、已支付工资等）。
- 如面临财产被执行的风险，应及时咨询专业律师，了解自身权益和应对策略。
总结：在老公作为承包方，手下员工因未签劳动合同而起诉公司的情况下，一般不会直接查妻子的财产。但为避免潜在风险，建议完善公司治理结构、谨慎处理夫妻共同财产，并在面临诉讼时积极应对。如有任何疑问或需要进一步法律帮助，请直接向我咨询。