被告将款项支付给原告后，针对已实施的财产保全，通常需分情况处理，具体如下：

1. 若保全措施尚未解除
   根据《民事诉讼法》第107条，财产保全的目的是保障未来生效判决的执行。若被告已主动履行全部债务（如支付赔偿款、归还借款等），原告应立即向法院提交《解除保全申请书》，并附上被告的付款凭证（如转账记录、收条等）。法院核实后会在3日内作出解除裁定，并通知相关机构（如银行、不动产登记中心）解除冻结或查封。
   注意：若原告未及时申请解除保全，被告可单独向法院提出异议，要求解除保全措施，法院审查属实后必须解除。

2. 若保全标的超出债务范围
   若被告支付的款项已覆盖原告主张的全部债权（包括本金、利息、诉讼费等），但保全措施仍涉及其他财产（如超额查封的房产、车辆等），被告可依据《民事诉讼法》第108条申请“超额保全异议”，要求法院解除对超额部分的保全。法院需在5日内审查，情况属实的应立即解除。

3. 若原告拒绝配合解除保全
   若被告已履行债务，但原告出于其他目的（如拖延执行、施压谈判等）拒绝申请解除保全，被告可采取以下措施：

   • 向法院申请强制解除：提交付款凭证及解除保全申请，法院可直接裁定解除；
     
   • 主张原告承担赔偿责任：若保全错误导致被告损失（如资金占用利息、经营损失等），被告可另案起诉原告要求赔偿。

4. 特殊情形：保全标的已处置
   若保全的财产（如冻结的银行账户）在被告付款前已被法院划扣至执行账户，此时被告支付给原告的款项可能被视为“自愿履行”，但需与法院沟通确认执行程序是否终止。若法院已将划扣款项发放给原告，被告可要求法院出具《结案证明》，避免后续纠纷。

实务建议：

• 被告付款时务必通过银行转账等可留痕的方式，并备注“履行（案号）案件债务”；
  
• 付款后立即联系原告或其律师，要求配合解除保全，并保留沟通记录；
  
• 若原告不配合，及时向法院提交书面申请，避免因保全持续产生额外损失。
  

如有具体案件细节（如保全标的类型、付款方式等），可进一步向我说明，我会结合实务经验提供更精准的建议。