检察院作出不起诉决定后，取保候审的保证金是会退还的。以下从不同角度为你详细分析：

法律依据角度

根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第七十三条的规定，犯罪嫌疑人、被告人在取保候审期间未违反本法第七十一条规定的，取保候审结束的时候，凭解除取保候审的通知或者有关法律文书到银行领取退还的保证金。检察院作出不起诉决定，意味着刑事诉讼程序在审查起诉阶段终结，犯罪嫌疑人不再面临刑事追诉，此时取保候审的措施也相应解除，保证金应当退还。

实际操作流程角度

1. 检察院通知：检察院在作出不起诉决定后，会通知执行取保候审的公安机关，告知其解除取保候审措施并退还保证金。
2. 公安机关处理：公安机关在收到检察院的通知后，会制作解除取保候审决定书、退还保证金决定书，并通知犯罪嫌疑人或者其家属到指定的银行领取退还的保证金。
3. 领取保证金：犯罪嫌疑人或者其家属在收到通知后，携带相关证件（如身份证、解除取保候审决定书等）到指定银行领取保证金。

特殊情况处理角度

虽然一般情况下检察院不起诉后保证金会退还，但也存在一些特殊情况可能导致保证金不予退还或者部分退还：

1. 违反取保候审规定：如果犯罪嫌疑人在取保候审期间违反了《中华人民共和国刑事诉讼法》第七十一条的规定，如未经执行机关批准离开所居住的市、县，或者干扰证人作证等，那么保证金可能不予退还，或者部分退还（如果已经部分履行了义务）。
2. 保证金来源不明或违法：如果保证金的来源存在违法情形，如使用赃款缴纳保证金，那么这部分保证金可能不会被退还，而是会被依法没收。

温馨提醒

• 保留相关证据：在领取保证金时，建议保留好解除取保候审决定书、退还保证金决定书等相关证据，以备不时之需。
• 及时沟通：如果在退还保证金过程中遇到任何问题，如公安机关未及时通知、银行拒绝支付等，建议及时与公安机关或检察院沟通，寻求解决方案。

如果你在取保候审或保证金退还方面遇到任何问题，或者有其他刑事辩护方面的疑问，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。