若乙方希望要回被冻结的合法资金，核心在于证明该资金与甲方涉案无关且具有合法性，可通过以下途径解决：

1. 向冻结机关提出书面异议
   根据《公安机关办理刑事案件适用查封、冻结措施有关规定》第31条，乙方作为利害关系人，有权向冻结机关（如公安机关、检察院）提交书面异议申请，附上资金来源证明（如合同、转账记录、发票等），要求解除冻结。需重点说明：

   • 资金属于乙方独立所有，与甲方涉案行为无关联；
     
   • 冻结行为已影响乙方正常经营或生活（如工资发放、货款结算等）。
     示例：若乙方为甲方供应商，可提供采购合同、送货单、已开票记录等，证明被冻结款项为未结算的合法货款。

2. 申请执行异议之诉（若案件进入执行阶段）
   若冻结已进入法院执行程序，乙方可依据《民事诉讼法》第234条，向执行法院提起“案外人执行异议之诉”，主张对被冻结资金的实体权利。需提交：

   • 资金所有权证明（如银行流水、财务账簿）；
     
   • 甲方涉案行为与资金无关的证据（如时间线对比、业务独立性证明）。
     注意：此途径需在知道冻结后15日内提出，逾期可能丧失权利。

3. 协商或调解
   若冻结机关认可资金合法性但需程序时间，乙方可与甲方协商，由甲方提供等值担保物（如房产、保证金）替换被冻结资金，或通过第三方监管账户暂存资金，待案件查清后返还。
   关键点：协商需书面化，明确担保范围、解冻条件及违约责任。

4. 申请国家赔偿（若冻结违法）
   若冻结机关存在超范围冻结、未及时解冻等违法行为，乙方可依据《国家赔偿法》第18条，在案件终结后向冻结机关申请赔偿，需提交：

   • 冻结决定书、解冻通知书等程序文件；
     
   • 资金被冻结期间的损失证明（如利息损失、经营亏损）。
     

风险提示：

• 操作前需全面梳理资金流向，避免因证据不足被认定为“与涉案资金混同”；
  
• 若甲方涉案为非法集资、诈骗等，需警惕资金被认定为“赃款”的风险，此时即使乙方合法，也可能需通过“退赔程序”按比例受偿。
  

建议行动步骤：

1. 立即整理资金来源证据（合同、转账记录等）；
   
2. 委托律师向冻结机关提交书面异议，同步准备执行异议之诉材料；
   
3. 同步与甲方沟通，评估协商可能性；
   
4. 定期跟进案件进展，避免超过申请时效。
   

如有具体证据或案件细节，可进一步向我说明，我会协助制定更精准的方案。