协议的复印件在特定情况下是有效的，但并非绝对有效，其效力取决于多种因素。以下是对此问题的详细分析：
一、协议复印件的一般效力原则
证据属性与局限性：
- 协议的复印件属于传来证据，根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》，无法与原件核对的复制件不能单独作为认定案件事实的根据。这意味着，在没有其他证据佐证的情况下，复印件的真实性和证明力往往受到质疑。
易篡改性与风险：
- 复印件因其易于被篡改和伪造，难以确保其与原始协议内容完全一致。在合同纠纷等案件中，若仅依赖复印件主张权利，而对方否认其真实性，法院通常不会仅凭此复印件来认定双方的权利义务关系。
二、协议复印件在特定情况下的有效性
对方认可：
- 如果协议的另一方当事人明确承认该复印件的内容和效力，基于当事人意思自治原则，该复印件在双方之间可被视为有效。例如，在借款纠纷中，若借款人承认借款协议复印件的内容真实，则该复印件在双方间具有证明借款关系的效力。
有其他证据佐证：
- 当协议复印件与其他相关证据（如聊天记录、转账记录、证人证言等）相互印证时，可形成完整的证据链条，增强复印件的证明效力。这些佐证证据应能直接或间接支持复印件的真实性和内容准确性。例如，在货物买卖合同纠纷中，合同复印件结合双方微信聊天记录及买方的签收单等证据，可证明合同关系的真实性。
合法性、自愿性与无违法情况：
- 除了上述条件外，还需考虑协议本身的内容是否合法、双方是否自愿签署以及是否存在欺诈、胁迫等违法情况。若协议内容违法或签署过程中存在不法行为，即使提供的是原件，也可能被视为无效。因此，复印件的有效性也受此限制。
三、建议与注意事项
尽可能使用并保存原件：
- 原件是最具法律效力的证据形式，应妥善保管并随时准备出示。在签订协议时，应尽量要求对方提供原件或确保自己能够获取并保存原件。
提供辅助证据：
- 如需使用复印件作为证据，应尽量同时提供其他相关证据以支持其真实性和有效性。这些辅助证据可以增强复印件的可信度，使其在法律上具有一定的证明价值。
注意协议内容的合法性和自愿性：
- 在签订协议时，应确保协议内容合法、双方自愿签署且不存在欺诈、胁迫等违法情况。这有助于确保协议的有效性，并减少因协议内容违法或签署过程不合法而导致的纠纷。
举例说明：
假设甲和乙签订了一份手写借款协议，但甲只保留了协议的复印件。后来，双方因借款问题发生纠纷。在这种情况下：
- 如果乙承认借款协议复印件的内容真实，那么该复印件在双方之间具有证明借款关系的效力。
- 如果乙否认复印件的真实性，但甲能够提供其他证据（如聊天记录、转账记录等）来佐证复印件的内容，那么这些辅助证据可以增强复印件的证明效力，使其在法律上具有一定的证明价值。
- 如果甲无法提供其他证据来佐证复印件的真实性，且乙坚持否认复印件的内容，那么法院可能不会仅凭该复印件来认定双方的权利义务关系。
综上所述，协议的复印件在特定情况下是有效的，但为确保最大的法律保护和避免潜在的纠纷，建议始终尽可能使用并保存协议的原件，并在必要时提供充分的辅助证据来支持复印件的真实性和有效性。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。