结论：公司发放工资分两次发放本身并不直接构成逃税行为，是否违法取决于公司的主观意图、工资发放方式及是否依法履行纳税义务。
一、合法情形下的工资分两次发放
合理薪酬结构安排：
- 企业可能基于合理的薪酬结构设计，将工资拆分为基本工资和绩效工资等不同部分，分别在不同时间发放。例如，基本工资按月固定发放，绩效工资则根据员工的工作表现和业绩考核结果确定后发放。这种拆分是出于企业薪酬管理的需要，并非为了避税。
- 关键点：只要企业按照税法规定，将两次发放的工资合并计算应纳税额，并依法代扣代缴个人所得税，就不构成逃税行为。
财务安排需要：
- 由于企业财务流程或资金调度的原因，工资也可能被分两次发放。如月底资金紧张时，先发放一部分以满足员工基本生活需求，待资金回笼后再补发剩余部分。这种安排是出于企业财务管理的实际需要，同样不属于避税行为。
- 关键点：企业需确保两次发放的工资均依法申报纳税，避免出现漏报、少报等情况。
二、违法情形下的工资分两次发放
故意隐瞒收入以逃税：
- 若企业故意通过分两次发放工资的方式，隐瞒或拆分员工的真实收入，以降低计税基数，少申报、少缴纳个人所得税，则属于逃税行为。例如，公司本应一次性发放给员工的工资，却故意拆分成两次发放，且仅按其中一次发放的金额申报纳税，隐瞒另一次发放的收入。
- 法律后果：根据《中华人民共和国税收征收管理法》的相关规定，这种偷税行为将面临税务机关的追缴、滞纳金以及罚款等处罚。情节严重者还可能构成犯罪，需依法追究刑事责任。
违反税收法规进行虚假申报：
- 若企业未按照法定程序进行纳税申报，或采取欺骗、隐瞒手段进行虚假纳税申报，逃避缴纳税款数额较大且占应纳税额百分之十以上，则可能构成逃税罪。
- 法律后果：逃税罪的认定主要包括侵犯税收征收管理秩序、采取欺骗或隐瞒手段进行虚假纳税申报或不申报、逃避缴纳税款数额较大且占应纳税额百分之十以上、主体为纳税人或扣缴义务人（包括自然人和单位）、以及主观上存在故意等要件。一旦构成逃税罪，将面临刑事处罚。
三、税务处理与法律规定
税务处理：
- 根据《中华人民共和国个人所得税法》的相关规定，个人的工资、薪金所得应当缴纳个人所得税，无论这些工资是按月一次发放还是分次发放。税务部门会合并两次发放的工资所得，按照合并后的金额来计算应缴纳的个人所得税。
- 关键点：企业需确保两次发放的工资均依法申报纳税，避免出现漏报、少报等情况。同时，员工也有权要求企业提供完整的工资发放记录和纳税证明。
法律规定：
- 企业应严格遵守税收法律法规的要求，进行合规的工资发放和税务申报。如有任何疑问或不确定之处，应及时咨询税务专业人士或向税务机关进行咨询和申报。
- 建议：企业应建立健全内部财务管理制度，确保工资发放和税务申报的准确性和合规性。同时，加强对员工的税法教育和培训，提高员工的税法意识和遵从度。
四、对员工和企业的建议
对员工的建议：
- 员工应关注自己的工资发放情况，确保每次发放的工资都依法申报纳税。如有疑问或发现企业存在逃税行为，应及时向税务机关举报或咨询专业律师。
- 关键点：员工有权要求企业提供完整的工资发放记录和纳税证明，以维护自己的合法权益。
对企业的建议：
- 企业应严格遵守税收法律法规的要求，进行合规的工资发放和税务申报。避免采取任何形式的逃税行为，以免面临法律后果和声誉损失。
- 关键点：企业应建立健全内部财务管理制度，加强税务风险管理，确保企业的合规运营和可持续发展。
总结：公司发放工资分两次发放本身并不直接构成逃税行为，关键在于是否符合法律法规的薪酬发放安排和是否依法履行纳税义务。作为员工和企业，都应遵守税收法律法规的要求，进行合规的工资发放和税务申报。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。