村书记和村会计共同套取村集体资金4000元，可能涉及违反党纪、职务违法甚至刑事犯罪，需根据具体情节和后果承担相应责任。具体分析如下：

1. 党纪责任
   根据《中国共产党纪律处分条例》第一百一十四条，套取集体资金可能构成“侵占公私财物”或“违反国家财经纪律”行为。若二人均为党员，即使金额未达刑事立案标准（如贪污罪3万元起），仍可能面临警告、严重警告、撤销党内职务等党纪处分，具体取决于情节轻重（如是否初犯、是否退赃、是否造成恶劣影响等）。

2. 职务违法责任
   依据《中华人民共和国监察法》及《政务处分法》，村书记和村会计作为基层群众性自治组织中从事管理的人员，属于监察对象。套取资金行为可能被认定为“职务侵占”或“滥用职权”，若金额未达刑事标准，可由监察机关给予警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等政务处分。

3. 刑事责任风险
   若套取资金行为符合《刑法》第三百八十二条（贪污罪）或第二百七十一条（职务侵占罪）构成要件，可能面临刑事追责：

   • 贪污罪：若二人利用职务便利，以侵吞、窃取、骗取等手段非法占有公共财物（村集体资金属公共财物），且数额达到3万元以上，或存在其他严重情节（如共同犯罪、多次贪污等），可能被处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；若金额未达3万元但具有特定情节（如曾因贪污受贿受过处分、拒不退赃等），仍可能被追究刑事责任。
     
   • 职务侵占罪：若村集体经济性质为私营（如村办企业），二人可能构成职务侵占罪，立案标准为6万元以上，但若存在多次侵占、共同犯罪等情节，即使未达6万元也可能被刑事立案。
     需注意：4000元未达贪污罪或职务侵占罪的刑事立案标准，但若存在其他恶劣情节（如手段恶劣、造成集体资产重大损失、引发群体性事件等），仍可能被认定为“其他较重情节”而追究刑事责任。

4. 民事赔偿责任
   无论是否承担党纪、政务或刑事责任，二人均需退赔套取的4000元资金。若资金已被挥霍或无法退赔，可能面临集体经济组织提起的民事诉讼，要求赔偿损失。

建议处理步骤：

1. 立即退赔：二人应主动将4000元退还至村集体账户，并书面说明情况，争取从轻处理。
   
2. 接受调查：配合纪检监察机关或公安机关的调查，如实陈述事实，避免隐瞒或伪造证据。
   
3. 法律咨询：若已被立案调查或面临指控，应及时委托律师介入，分析行为性质、证据链条及量刑情节，制定辩护策略。
   

提示：具体责任需结合资金性质（如是否为扶贫款、救灾款等特殊资金）、套取手段（如伪造单据、虚报项目等）、资金用途（如是否用于个人消费或集体活动）等细节综合判断。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体情节。