押金是否能够从店铺租金中扣除后返还，需根据租赁合同的具体约定以及双方协商情况来确定，以下是具体分析：

1. 合同有明确约定：

   • 如果租赁合同中明确规定了押金的退还方式，包括是否可以从租金中扣除以及扣除后的剩余金额如何处理，那么双方应当按照合同约定执行。
   • 例如，合同可能规定，在租赁期满且承租人无违约行为的情况下，出租人应在一定期限内将押金全额退还；或者规定，如果承租人存在违约行为，出租人有权从押金中扣除相应金额作为赔偿，剩余部分退还。

2. 合同无明确约定或约定不明：

   • 如果合同中没有明确规定押金的退还方式，或者规定不明确，那么双方应当通过协商来确定。
   • 在协商过程中，可以考虑租赁期间的实际使用情况、承租人的违约情况（如有）、出租人的实际损失（如有）等因素，来合理确定押金的退还金额和方式。
   • 如果双方无法达成一致意见，可能需要通过法律途径来解决争议，如提起诉讼或申请仲裁。

3. 实际操作建议：

   • 在租赁期满或合同解除时，承租人应及时向出租人提出退还押金的请求，并提供相关证明材料（如租赁合同、租金支付凭证、押金收据等）。
   • 出租人在收到承租人的请求后，应及时审核相关材料，并根据合同约定或双方协商的结果来退还押金。
   • 如果出租人无正当理由拒绝退还押金或扣除的金额不合理，承租人可以通过法律途径来维护自己的合法权益。

在处理押金退还问题时，建议双方保持沟通、理性协商，并尽量通过书面形式来确认协商结果，以避免后续产生不必要的纠纷。如果还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。