是的，执行款在一般情况下应当优先支付给申请执行人，但具体分配顺序需结合案件实际情况和法律规定综合判断。以下是详细分析：

1. 基本原则：申请执行人优先受偿
   根据《民事诉讼法》及相关司法解释，执行程序的核心目的是实现生效法律文书确定的债权。因此，执行款在扣除执行费用（如诉讼费、保全费、执行费等）后，原则上应优先支付给申请执行人。这是执行程序的基本逻辑，旨在保障债权人的合法权益。

2. 特殊情形下的分配顺序调整
   若存在多个债权人参与分配（如被执行人财产不足以清偿全部债务），则需根据《最高人民法院关于适用〈民事诉讼法〉的解释》第508-512条的规定，按以下顺序处理：

   • 优先受偿权：享有抵押权、质权、留置权等担保物权的债权人，可就担保财产优先受偿；
     
   • 普通债权按比例分配：剩余财产在普通债权人之间按债权比例分配；
     
   • 特殊优先权：如职工工资、税款等可能享有法定优先权，需根据具体法律规定处理。
     示例：若被执行人房产被抵押给银行，则拍卖款需先清偿银行贷款，剩余部分再分配给其他债权人。

3. 执行费用优先扣除
   根据《诉讼费用交纳办法》第20条，执行申请费由被执行人负担，但实践中通常从执行款中直接扣除。因此，实际支付给申请执行人的金额=执行款总额-执行费用-其他优先债权。
   注意：若被执行人财产不足以支付全部费用，法院可能终结本次执行程序，待发现财产后恢复执行。

4. 实务建议

   • 申请执行人可申请财产保全，确保执行款不被转移；
     
   • 若发现被执行人有其他财产，应及时向法院提供线索；
     
   • 对分配方案有异议的，可在收到通知后15日内向法院提出书面异议。

总结：执行款的分配以申请执行人优先为原则，但需根据案件是否涉及优先权、多个债权人等因素动态调整。如有具体案件疑问，可直接向我咨询，我会结合案情进一步分析。