可以维权。商品包装申请了美术作品登记后，若发现他人未经许可使用该包装设计，您有权通过法律途径维护自身权益。以下是具体分析：

1. 美术作品登记的法律效力
   根据《著作权法》，美术作品自创作完成之日起自动享有著作权，登记并非权利产生的必要条件，但登记证书是证明著作权归属的初步证据。若包装设计具有独创性（如独特的图案、色彩搭配、造型等），可被认定为美术作品，登记后能更高效地主张权利。

2. 维权的核心依据

   • 著作权侵权：若他人未经许可复制、发行、展览或通过信息网络传播您的包装设计，构成对复制权、发行权等著作权的侵犯。
     
   • 不正当竞争：若对方模仿包装设计导致消费者混淆（如误认商品来源），可能违反《反不正当竞争法》第六条，构成混淆行为。

3. 维权的具体方式

   • 协商解决：可先向侵权方发送律师函，要求停止侵权并赔偿损失。
     
   • 行政投诉：向市场监督管理部门举报，请求查处侵权行为（如没收侵权商品、罚款）。
     
   • 民事诉讼：向法院起诉，主张停止侵害、赔偿损失（包括实际损失或侵权人违法所得，或法定赔偿500元至500万元）。
     
   • 刑事报案：若侵权情节严重（如违法所得数额巨大），可向公安机关报案，追究刑事责任。

4. 需注意的例外情形

   • 合理使用：若他人为个人学习、研究或欣赏使用少量包装设计，可能不构成侵权。
     
   • 在先权利冲突：若您的包装设计侵犯了他人在先权利（如商标权、外观设计专利权），可能被反诉侵权。
     
   • 超过诉讼时效：著作权侵权诉讼时效为3年，自权利人知道或应当知道侵权行为之日起计算。

建议行动步骤：

1. 固定侵权证据（如公证购买侵权商品、截图网页宣传等）；
   
2. 委托律师分析侵权范围及赔偿数额；
   
3. 根据侵权情节选择协商、投诉或诉讼方式维权。
   

若需进一步评估具体案件，可提供包装设计图片、登记证书及侵权证据，我将为您制定详细维权方案。