代理人是否有义务提醒对方更换发票，需分情况讨论：

1. 基于委托代理合同的具体约定
   若双方在委托代理合同中明确约定了代理人需对发票合规性进行审核并提醒更换（例如合同条款载明“代理人应协助委托人处理财务票据问题，发现发票瑕疵时应及时通知更换”），则代理人需履行该义务。此时义务来源为合同约定，若未履行可能构成违约，需承担相应责任。

2. 基于法律规定的附随义务
   根据《民法典》第五百零九条，当事人应遵循诚信原则履行通知、协助等附随义务。若代理人明知发票存在瑕疵（如抬头错误、税号缺失、盖章不清等）且该瑕疵可能影响委托人权益（如无法抵扣税款、被税务机关处罚），则代理人有义务提醒对方更换。此时义务来源为法律规定的诚信原则，未履行可能需赔偿委托人因此遭受的损失。

3. 基于行业惯例或交易习惯
   若代理人所在行业（如财务代理、法律服务）存在“审核票据并提示风险”的普遍惯例，或双方长期交易中形成“代理人主动提示票据问题”的习惯，则代理人可能被推定为负有提醒义务。此时需结合具体行业规则或双方交易历史综合判断。

实务建议：

• 对委托人而言：若希望代理人承担提醒义务，应在合同中明确约定，并保留代理人未履行的证据（如沟通记录、瑕疵发票复印件）。
  
• 对代理人而言：即使合同未约定，发现发票瑕疵时也应主动提示，避免因未履行附随义务被追责；若无法确定是否需提醒，可书面告知委托人风险并留存证据。
  

如有具体场景或合同条款需要分析，可进一步向我说明。