要确认与物流公司签订合作协议后是否存在劳务关系，可从以下方面综合判断：

1. 协议内容与实际履行情况

   • 书面协议条款：首先审查合作协议的具体内容。若协议中明确约定了双方为劳务关系（如约定了工作时间、地点、报酬支付方式、服从管理等内容），且双方实际按照该约定履行，则可初步认定为劳务关系。
   • 实际履行特征：若协议虽名为“合作协议”，但实际履行中，一方接受另一方的管理、指挥和监督，从事对方安排的工作，并定期领取报酬，则更符合劳务关系的特征。

2. 劳务关系与劳动关系的区分

   • 劳动关系特征：劳动关系通常具有稳定性、长期性，劳动者需遵守用人单位的规章制度，接受用人单位的管理，从事用人单位安排的有报酬的劳动。若符合这些特征，可能被认定为劳动关系，而非劳务关系。
   • 劳务关系特征：劳务关系则更注重一次性或临时性的工作成果交付，双方地位相对平等，不存在严格的管理与被管理关系。若合作协议更侧重于工作成果的交付，而非工作过程的控制，则更可能被认定为劳务关系。

3. 关键证据收集

   • 工作记录：收集工作过程中的相关记录，如工作安排、工作汇报、工作成果等，以证明实际履行情况。
   • 报酬支付凭证：保留报酬支付的银行转账记录、收据等，以证明报酬的支付方式和金额。
   • 管理证据：若存在接受对方管理的情况，如考勤记录、工作指令等，也应作为证据收集。

4. 法律适用与判断

   • 依据法律法规：根据《中华人民共和国民法典》中关于劳务合同的规定，以及劳动法律法规中关于劳动关系的认定标准，综合判断双方的法律关系。
   • 司法实践参考：参考类似案例的司法判决，了解法院在类似情况下的认定标准和裁判思路。

5. 建议与行动

   • 协商确认：若双方对法律关系存在争议，可首先尝试通过协商方式确认，并签订书面确认文件。
   • 法律途径解决：若协商无果，可寻求法律途径解决，如向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。在此过程中，应充分准备上述关键证据，以支持自己的主张。