针对您的情况，若对方摩托车无证逆行导致您中度颅脑损伤加嗅觉丧失，且对方被认定为主责但拒绝理赔，您可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 收集并固定证据：

   • 事故现场证据：包括事故现场的照片、视频，以及目击者的联系方式和证言。这些证据能够直观展示事故发生的经过和对方的违规行为。
   • 医疗证据：保留好所有与治疗相关的医疗记录、诊断证明、费用清单等。这些证据是证明您受伤程度和医疗费用的关键。
   • 责任认定书：确保您已经获取了交警部门出具的事故责任认定书，并且该认定书明确对方为主责。这是后续索赔的重要依据。

2. 与对方协商：

   • 在收集完证据后，您可以尝试与对方进行协商，要求其按照责任比例进行赔偿。在协商过程中，保持冷静和理性，明确表达您的诉求和依据。
   • 如果对方同意赔偿，建议签订书面赔偿协议，并明确赔偿金额、支付方式和时间等条款，以避免后续纠纷。

3. 向保险公司索赔（如适用）：

   • 如果对方车辆有投保交强险或商业险，您可以向对方的保险公司提出索赔申请。保险公司会根据保险合同和事故责任认定书进行赔付。
   • 在向保险公司索赔时，提供完整的证据材料，并按照保险公司的要求填写索赔申请表。

4. 提起民事诉讼：

   • 诉讼准备：如果协商无果或对方拒绝赔偿，您可以向法院提起民事诉讼。在起诉前，准备好所有证据材料，并撰写起诉状，明确诉讼请求和事实理由。
   • 诉讼过程：在诉讼过程中，您需要按照法院的要求参加庭审，并提交证据材料。法院会根据事实和法律规定作出判决，要求对方承担赔偿责任。
   • 执行判决：如果对方不履行判决，您可以向法院申请强制执行。法院会采取一系列措施来强制对方履行赔偿义务，如查封、扣押、拍卖财产等。

5. 考虑刑事责任：

   • 由于对方存在无证逆行的严重违规行为，且导致了您中度颅脑损伤加嗅觉丧失的严重后果，对方的行为可能构成交通肇事罪。
   • 您可以向公安机关报案，要求追究对方的刑事责任。如果对方被认定构成犯罪，除了承担民事赔偿责任外，还可能面临刑事处罚。

在采取上述措施时，您需要注意以下几点：

• 时效性：根据《中华人民共和国民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。因此，您需要在诉讼时效期间内提起诉讼或采取其他法律措施。
• 专业性：由于法律程序复杂且专业性强，建议您在处理此类纠纷时咨询专业律师的意见。律师能够为您提供专业的法律建议和指导，帮助您更好地维护自己的合法权益。

最后，我建议您保持冷静和理性，积极收集证据并采取合适的法律措施来维护自己的权益。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。