结论：女方父亲有案底一般不会直接影响军人晋升，但需分情况讨论，具体如下：

1. 军人晋升的考察重点
   根据《军队干部选拔任用工作规定》及相关政策，军人晋升主要考察其政治素质、军事能力、工作实绩、廉洁自律等个人表现，核心是军人自身的政治可靠性和履职能力。直系亲属的刑事犯罪记录通常不直接构成晋升的法定障碍，但需结合具体案情和岗位性质综合判断。

2. 需关注“政治审查”的关联性

   • 常规岗位：若军人晋升岗位不涉及机要、保密、安全敏感领域（如情报、特战、核心科研等），亲属案底一般不影响晋升。
     
   • 特殊岗位：若岗位需通过严格政治审查（如涉及国家安全、军事机密等），亲属的犯罪记录可能成为审查参考因素。但审查重点仍是军人本人是否受亲属行为影响（如是否存在包庇、纵容等），而非单纯因亲属有案底直接否决。

3. 案底性质的影响

   • 一般刑事犯罪（如盗窃、诈骗等）：若军人本人未参与或不知情，通常不构成晋升障碍。
     
   • 危害国家安全类犯罪（如叛国、间谍等）：即使军人本人无直接行为，亲属的此类案底可能引发组织对军人政治忠诚度的额外审查，但需以具体证据为准，不会“一概否定”。

4. 实践中的处理原则
   军队政治审查遵循“实事求是、区别对待”原则，重点考察军人本人的现实表现。若女方父亲案底与军人无关，且军人能通过组织考察（如无其他不良记录、工作表现突出），一般不会影响晋升。

建议：
若军人或家属对此仍有顾虑，可主动向所在单位政治部门说明情况，配合组织审查。如有具体案情或岗位类型需要进一步分析，可直接向我咨询，我会结合政策细节为您详细解答。