核心结论：若发现电子章未经授权被使用，可采取以下措施处理，具体分为民事维权、行政投诉、刑事报案三个方向，需根据实际损害后果和证据情况选择适用。

1. 民事维权：主张侵权赔偿或合同无效

• 法律依据：根据《民法典》第1165条，未经授权使用电子章属于侵犯法人或自然人权益的行为，权利人可要求停止侵害、赔偿损失。若电子章被用于签订合同，可依据《民法典》第154条主张合同因恶意串通或欺诈而无效。
• 操作步骤：
  1. 固定证据：保存电子章使用记录（如邮件、文档、系统日志）、授权文件（如有）、对方身份信息等；
  2. 发送律师函：要求对方立即停止使用并赔偿损失；
  3. 提起诉讼：向法院起诉侵权或确认合同无效，主张赔偿实际损失（如直接经济损失、维权费用）及合理利润损失。

2. 行政投诉：向市场监管部门举报

• 适用场景：若电子章被用于虚假宣传、商业欺诈等违反《市场监督管理行政处罚程序暂行规定》的行为，可向当地市场监管部门投诉。
• 操作步骤：
  1. 准备材料：提交投诉书、电子章使用证据、对方主体信息；
  2. 跟进处理：市场监管部门将调查并可能对违法行为人处以罚款、责令改正等行政处罚。

3. 刑事报案：追究刑事责任

• 适用条件：若电子章被用于伪造公司印章、合同诈骗等行为，且达到刑事立案标准（如诈骗金额超3000元），可向公安机关报案。
• 法律依据：根据《刑法》第280条（伪造公司印章罪）、第266条（诈骗罪），行为人可能面临有期徒刑、拘役或罚金。
• 操作步骤：
  1. 报案材料：提交报案书、电子章使用证据、损失证明（如银行流水、合同）；
  2. 配合调查：协助公安机关取证，推动刑事立案。

关键注意事项

1. 证据效力：电子章需通过可信时间戳、区块链存证等方式固定，确保符合《电子签名法》第13条关于可靠电子签名的要求；
2. 及时止损：发现未经授权使用后，应立即通过公告、系统权限调整等方式阻止进一步使用；
3. 预防措施：建议使用第三方电子签名平台（如e签宝、法大大），通过CA认证和加密技术降低风险。

建议：根据损害后果严重程度选择处理方式。若仅涉及民事纠纷，优先通过律师函或诉讼解决；若涉嫌违法犯罪，需及时报案。具体操作可进一步向我提供细节，我将协助制定方案。