事业单位发放三个月劳务费是否合法，不能一概而论，需要结合具体情况来判断。以下从不同角度进行分析：
一、合法情形
存在合法劳务关系且符合约定：
- 如果事业单位与个人之间建立了合法的劳务关系，并且双方在劳务合同中明确约定了劳务费的支付方式和周期，包括可以一次性支付三个月劳务费的情况，那么这种支付方式就是合法的。
- 例如，事业单位因项目需要临时聘请外部专家或技术人员，双方签订劳务合同，约定项目期间（可能跨越三个月）的劳务费总额，并在项目开始或结束时一次性支付，这是完全合法的。
符合相关法律法规和政策规定：
- 事业单位在支付劳务费时，需要遵守国家相关的法律法规和政策规定，如《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》以及关于事业单位人事管理的相关规定等。
- 如果支付三个月劳务费的行为符合这些法律法规和政策规定，那么就是合法的。例如，某些特殊情况下，如疫情期间为了保障员工生活，事业单位可能根据政策规定提前支付部分劳务费。
二、不合法情形
无合法劳务关系或违反约定：
- 如果事业单位与个人之间没有建立合法的劳务关系，或者双方在劳务合同中没有约定可以一次性支付三个月劳务费，而事业单位却擅自这样做了，那么这种行为就是不合法的。
- 例如，事业单位未经批准擅自雇佣临时工，并一次性支付三个月工资，这可能违反了事业单位人事管理规定和财务管理规定。
违反相关法律法规和政策规定：
- 如果支付三个月劳务费的行为违反了国家相关的法律法规和政策规定，如未经批准擅自提高劳务费标准、未按照规定程序支付劳务费等，那么这种行为也是不合法的。
- 例如，事业单位未按照财政部门的规定进行劳务费支付，可能面临财务违规的风险。
三、法律建议
审查劳务合同：
- 事业单位和个人在签订劳务合同时，应明确约定劳务费的支付方式和周期，确保符合双方的约定和法律法规的规定。
遵守相关法律法规和政策规定：
- 事业单位在支付劳务费时，应严格遵守国家相关的法律法规和政策规定，确保支付行为的合法性和合规性。
及时咨询和沟通：
- 如果对劳务费的支付方式或周期有疑问或争议，事业单位和个人应及时咨询相关部门或专业人士的意见，并进行沟通协商，以达成合法合规的解决方案。
总结来说，事业单位发放三个月劳务费是否合法，取决于是否存在合法劳务关系、是否符合约定以及是否遵守相关法律法规和政策规定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。