关于公司本地注册异地经营是否合法的问题，这主要取决于具体的法律法规以及地方政策。以下是我为您提供的详细解答：
首先，从国家层面来看，国家发展改革委印发的《全国统一大市场建设指引(试行)》明确提出，各地区不得妨碍经营主体依法平等准入、退出和迁移，不得要求经营主体必须在某地登记注册。这一政策旨在打破地域壁垒，促进市场公平竞争，为经营主体提供更加宽松、便利的经营环境。因此，从原则上讲，公司本地注册异地经营并不违反国家层面的规定。
其次，从地方政策来看，不同地区可能存在差异。以上海市为例，新修订的《上海市优化营商环境条例》已于2024年11月1日起施行，其中明确规定，本市登记的经营主体可以在登记住所以外开展经营活动，无需向市场监管部门申请办理经营主体登记备案手续（法律、行政法规另有规定的，从其规定）。这一政策进一步放宽了经营主体的经营场所限制，为异地经营提供了更加明确的法律依据。
然而，也需要注意到，虽然国家政策和地方政策都在逐步放宽经营主体的经营场所限制，但仍然存在一些特殊情况或特定行业可能需要遵循特定的规定。例如，某些行业可能由于监管需要或安全考虑，要求经营主体必须在特定地点进行注册或经营。
因此，对于公司本地注册异地经营是否合法的问题，我的建议是：
了解并遵守国家层面的法律法规：确保公司的经营活动符合国家层面的规定，不违反任何法律法规。
关注并遵循地方政策：不同地区可能存在不同的政策规定，公司应密切关注并遵循当地政策，确保经营活动的合法性。
咨询相关部门或专业机构：如果公司对异地经营的政策规定存在疑问或不确定，建议咨询当地市场监管部门或专业机构，以获取更加准确、权威的信息。
综上所述，公司本地注册异地经营在大多数情况下是合法的，但具体还需根据国家法律法规和地方政策来判断。公司应密切关注政策动态，确保经营活动的合法性和合规性。