结论：仲裁赢了但公司股权变更，一般情况下不影响仲裁裁决的执行，因为仲裁裁决具有相对独立性，不因公司股权变更而失效。不过，具体执行情况还需结合股权变更的性质、时间节点以及执行措施等因素综合判断。以下从不同角度为你详细分析：

股权变更不影响仲裁裁决效力的角度

仲裁裁决是仲裁机构根据双方当事人的仲裁协议，对争议事项进行审理后作出的具有法律效力的裁决。一旦裁决作出，就具有既判力和执行力，不因公司股权的变更而改变。例如，你和公司之间因劳动纠纷申请仲裁，仲裁机构裁决公司需向你支付一定数额的赔偿金。即便在仲裁裁决作出后，公司发生了股权变更，新股东也不能以股权变更为由拒绝履行仲裁裁决确定的义务。因为仲裁裁决的效力是针对公司这一法律主体，而不是特定的股东。

股权变更可能影响执行措施的角度

虽然股权变更不影响仲裁裁决的效力，但在实际执行过程中，可能会因股权变更的情况而面临一些不同的执行措施选择。

• 股权转让时间在仲裁裁决作出前：如果股权转让发生在仲裁裁决作出之前，且原股东在转让股权时存在恶意逃避债务的情形，比如低价转让股权、无偿转让股权等，那么你可以向法院申请撤销该股权转让行为。根据《民法典》第五百三十八条规定，债务人以放弃其债权、放弃债权担保、无偿转让财产等方式无偿处分财产权益，或者恶意延长其到期债权的履行期限，影响债权人的债权实现的，债权人可以请求人民法院撤销债务人的行为。在这种情况下，你可以通过撤销股权转让行为，恢复公司的责任财产，从而保障仲裁裁决的执行。
• 股权转让时间在仲裁裁决作出后：若股权转让发生在仲裁裁决作出之后，新股东在受让股权时知道或者应当知道公司存在未履行的仲裁裁决债务，那么新股东可能需要在其受让股权的范围内对公司债务承担连带责任。不过，要证明新股东存在“知道或者应当知道”的情形，需要你提供相应的证据，比如股权转让协议中是否有相关约定、新股东是否参与了公司的经营管理等。

执行过程中的实际操作建议

• 及时申请强制执行：在拿到仲裁裁决后，应尽快向有管辖权的人民法院申请强制执行。根据《民事诉讼法》第二百四十六条规定，申请执行的期间为二年。申请执行时效的中止、中断，适用法律有关诉讼时效中止、中断的规定。及时申请强制执行可以避免因时间拖延导致公司财产状况发生变化，增加执行难度。
• 调查公司财产状况：在申请强制执行后，要积极配合法院调查公司的财产状况，包括银行存款、房产、车辆、股权等。如果发现公司有可供执行的财产，及时向法院提供线索，以便法院采取相应的执行措施。
• 关注股权变更情况：密切关注公司的股权变更情况，如果发现公司存在恶意转让股权等逃避债务的行为，及时收集证据并向法院反映，以便法院采取相应的措施保障你的合法权益。

如果你在执行过程中遇到任何问题，都可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供更详细的法律建议。