在解答您的问题“比对样本未质证违反了哪条规定”之前，需要明确的是，“比对样本未质证”这一行为通常出现在司法鉴定、检验检测或相关技术服务的语境中，它指的是在出具检验检测报告或相关结论前，未对所使用的比对样本进行充分的质证或确认。虽然直接的法律条文可能并未明确提及“比对样本未质证”，但我们可以根据相关法律法规的精神和原则，结合类似案例，来推断这一行为可能违反的规定。

首先，从广义上讲，任何检验检测活动都应当遵循科学、公正、准确的原则，并确保所使用的样本、方法、程序等均符合相关标准和规范。如果比对样本未经质证就被用于检验检测，那么这一过程的科学性和公正性就会受到质疑，从而可能影响到最终结论的准确性和可靠性。

接下来，我们结合具体案例来分析：

1. 吉林市生态环境局行政处罚案例：

   • 在该案例中，吉林恒祥环境检测有限公司因未严格执行国家生态环境监测规范、技术标准及操作规程，导致相关监测、采样数据失真。虽然案例并未直接提及“比对样本未质证”，但该公司未遵守监测规范和技术标准的行为，与比对样本未经质证可能导致的后果（即数据失真）是相似的。
   • 该案例依据的是《生态环境监测条例》第三十条第一款和第四十三条，其中第三十条第一款规定“技术服务机构接受委托开展监测服务，应当遵守生态环境监测规范和标准”，这可以类比为检验检测活动应遵循的基本原则。

2. 西和县建筑材料试验室行政处罚案例：

   • 在该案例中，西和县建筑材料试验室因未按规定对检验检测原始记录和报告进行归档留存、未设置样品室及留样室等行为，被认定为出具不实检验检测报告。虽然案例同样未直接提及“比对样本未质证”，但未按规定留存样本和记录的行为，也暗示了样本管理的不规范，这与比对样本未经质证可能存在的问题（如样本来源不明、样本状态不确定等）是相关的。
   • 该案例依据的是《检验检测机构监督管理办法》和《检验检测机构资质认定管理办法》，其中涉及了对检验检测机构的基本条件、技术能力、样本管理等方面的要求。

综合推断： 虽然直接的法律条文可能并未明确提及“比对样本未质证”，但根据检验检测活动应遵循的科学、公正、准确原则，以及相关法律法规对检验检测机构的基本条件、技术能力、样本管理等方面的要求，我们可以推断：比对样本未质证可能违反了检验检测活动应遵循的基本规范和标准，以及相关法律法规中关于样本管理、数据真实性等方面的规定。具体来说，可能涉及《检验检测机构监督管理办法》、《检验检测机构资质认定管理办法》以及相关行业规范或标准中关于样本采集、保存、处理、质证等方面的要求。

建议： 为了避免类似问题的发生，检验检测机构应建立完善的样本管理制度，确保比对样本的采集、保存、处理、质证等环节均符合相关标准和规范。同时，加强内部质量控制和外部审核，确保检验检测活动的科学性和公正性。