结论：亲子鉴定通常指的是父母与子女之间的鉴定，而和舅舅一起做的是亲缘关系鉴定，而非传统意义上的亲子鉴定。这种鉴定可以判断你们是否来自同一父系家族，但无法直接确定具体的遗传关系比例。
详细分析：
亲缘关系鉴定与亲子鉴定的区别：
- 亲子鉴定：主要是确认父母与子女之间的亲生血缘关系，它依据的是孟德尔遗传定律，通过检测双方的DNA来确定是否存在直接的遗传联系。
- 亲缘关系鉴定：则更广泛地用于评价有争议个体之间是否存在遗传、代际或其他血缘关系。在你提到的情况下，即和舅舅一起做鉴定，就属于亲缘关系鉴定中的Y染色体亲缘鉴定（如果都是男性的话）。
Y染色体亲缘鉴定的原理：
- 男性的Y染色体遗传自父亲，并会稳定地传给儿子。因此，同一父系家族的男性Y染色体具有高度的一致性。
- 通过检测你和舅舅的Y染色体上的特定遗传标记，可以判断你们是否来自同一父系家族，从而间接推测出你们之间的亲缘关系。
鉴定结果的解读：
- 亲缘关系鉴定结果只能说明你们是否来自同一父系，无法像亲子鉴定那样直接确定具体的遗传关系比例。
- 在绝大多数情况下，你和舅舅之间的亲缘关系鉴定结果会表明你们存在亲缘关系（即来自同一父系），但无法确定是直系还是旁系，以及具体的亲缘远近。
- 特殊情况下，如你的父亲和舅舅是同卵双胞胎，那么你和舅舅之间的遗传物质可能高度相似，此时进行亲子鉴定（如果错误地进行了这种鉴定）可能会出现肯定的结果，但这种情况极为罕见，且实际上应该进行的是亲缘关系鉴定。
鉴定的法律与伦理要求：
- 进行亲缘关系鉴定时，必须遵守相关的法律和伦理规定，确保测试的公正性和保密性。
- 鉴定结果应由具有资质、信誉良好的正规司法鉴定机构出具，以确保结果的准确性和可靠性，并作为法律上的有效证据使用。
法律建议：
- 如果你需要进行亲缘关系鉴定，建议选择正规的司法鉴定机构，并确保他们具有相关的资质和经验。
- 在进行鉴定前，最好咨询专业的法律人士或遗传学家，以了解鉴定的具体流程、可能的结果以及结果的法律效力。
- 鉴定结果出来后，如果涉及法律纠纷或家庭关系调整，建议再次咨询专业律师，以便根据鉴定结果制定合适的法律策略。
希望这些分析能对你有所帮助。如果你有任何其他关于婚姻家庭领域的法律问题，都可以直接向我咨询。