合同效力并不完全取决于合同文本的持有情况，即使两份培训合同都在公司手上，合同仍然可能有效。以下从几个方面进行详细分析：
合同效力的基本原则
合同效力主要取决于合同的内容是否合法、双方意思表示是否真实、是否违反法律法规的强制性规定等因素，而非单纯由合同文本的持有情况决定。只要合同本身符合法律规定的生效要件，即使合同文本全部由一方持有，合同仍然具有法律效力。
合同文本持有的影响
证据问题：虽然合同文本的持有情况本身不影响合同效力，但在发生争议时，合同文本是证明合同关系及合同内容的重要证据。如果两份合同都在公司手上，员工可能面临举证困难的问题。然而，这并不意味着合同无效，员工仍可以通过其他证据（如电子邮件、短信、录音、证人证言等）来证明合同的存在及内容。
公平性考量：如果公司利用持有合同文本的优势地位，单方面修改合同内容或拒绝履行合同义务，这可能构成违约或欺诈行为。在这种情况下，员工可以依法维护自己的合法权益，包括要求公司履行合同、赔偿损失等。
实际操作建议
要求公司提供合同副本：员工有权要求公司提供其持有的合同副本，以便了解合同内容并保障自己的权益。如果公司拒绝提供，员工可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
保留其他证据：员工应尽可能保留与合同相关的其他证据，如电子邮件、短信、录音、证人证言等，以备不时之需。
咨询专业律师：如果员工对合同的效力或公司的行为存在疑虑，可以咨询专业律师以获取法律意见和帮助。律师可以根据具体情况分析合同的法律效力及员工的权益，并提供相应的法律建议。
可能的法律后果
如果公司利用持有合同文本的优势地位进行不正当行为（如单方面修改合同内容、拒绝履行合同义务等），员工可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。在仲裁或诉讼过程中，员工需要提供充分的证据来证明自己的主张。如果证据充分且合理，仲裁机构或法院将依法裁决公司承担相应的法律责任。
总结来说，即使两份培训合同都在公司手上，合同仍然可能有效。员工应关注合同内容本身是否合法、双方意思表示是否真实等因素，并保留好其他相关证据以备不时之需。如有需要，可以随时向我咨询相关法律问题。