关于案件取保候审两年后的处理方式，需分情况讨论，具体如下：
一、取保候审的法定期限与特殊情况
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第七十九条，取保候审的最长期限为十二个月。若案件在取保候审期间移送审查起诉或审判阶段，期限需重新计算，但实践中取保候审两年已远超法定最长期限，属于异常情况。可能的原因包括：
- 案件复杂或证据不足：导致办案机关未能及时结案；
- 程序衔接问题：如侦查阶段与审查起诉阶段衔接不畅；
- 特殊审批延长：极少数情况下，经严格审批可能延长，但需符合法定条件。
二、期满后的常规处理流程
若取保候审已满两年且未依法延长，当事人有权要求解除取保候审，具体流程如下：
解除取保候审：
- 执行机关（如公安机关）应在3日内书面通知决定机关（如检察院或法院）；
- 决定机关收到通知后，立即制作《解除取保候审决定书》和《退还保证金决定书》，送达被取保候审人并退还保证金；
- 被取保候审人需在7日内到指定银行领取退还的保证金。
后续司法程序衔接：
- 案件终结：若经查证不构成犯罪或不应追究刑事责任，案件终结，取保候审解除；
- 诉讼程序继续：若案件需继续审理，取保候审解除后，当事人可能面临逮捕、监视居住等其他强制措施，或直接进入审判阶段。
三、当事人权利保障措施
知情权：
- 当事人有权要求办案机关说明取保候审状态及后续处理程序；
- 若超期未处理，可向同级检察院申请监督，要求纠正违法行为。
救济途径：
- 认为处理不当的，可向上级机关申诉；
- 发现办案机关违法违纪行为的，可向纪检监察部门举报。
四、特殊情况处理
若取保候审期间发现新证据或案情重大复杂，办案机关可能依法变更为监视居住或逮捕，并重新办理法律手续，告知当事人权利义务。此时，当事人需配合新的强制措施，并关注案件进展。
五、实务建议
- 及时沟通：若取保候审即将期满或已超期，主动联系办案机关了解案件进展；
- 保留证据：保存取保候审决定书、保证金收据等文件，以备后续维权；
- 法律咨询：如对处理流程有疑问，可直接向我咨询，我将结合具体案情提供专业建议。
总结：取保候审两年已超法定最长期限，当事人有权要求解除并退还保证金。若案件未终结，需配合后续司法程序；若认为处理不当，可通过申诉或监督途径维权。如有进一步疑问，欢迎随时向我咨询。