意外险只赔9000多元而医疗费为12758元，可能存在以下几种情况：

1. 保险合同中的免赔额条款：

   • 许多意外险合同中会设定免赔额，即保险公司不承担赔偿责任的最低金额。如果您的保险合同中有免赔额条款，并且免赔额的金额较高，那么保险公司只会对超出免赔额的部分进行赔偿。例如，如果免赔额为3000元，那么保险公司只会赔偿9758元（12758元 - 3000元），但实际赔偿金额可能因合同具体条款而有所调整，如存在其他限制或扣除项。

2. 赔偿比例限制：

   • 意外险合同中可能规定了对不同类型医疗费用的赔偿比例。例如，合同可能规定对药品费用赔偿80%，对手术费用赔偿90%等。如果您的医疗费用中包含了多种类型的费用，并且每种费用的赔偿比例不同，那么最终赔偿金额可能会低于总医疗费用。

3. 非保障范围内的费用：

   • 意外险通常只赔偿因意外事故导致的直接医疗费用。如果您的医疗费用中包含了与意外事故无关的费用，如慢性病治疗费用、美容整形费用等，那么这些费用将不会被保险公司赔偿。此外，如果合同中明确排除了某些特定类型的医疗费用（如进口药品费用、特殊检查费用等），那么这些费用也不会被赔偿。

4. 保险金额限制：

   • 意外险合同中通常会设定一个总的保险金额，即保险公司最多赔偿的金额。如果您的医疗费用超过了这个保险金额，那么保险公司只会按照保险金额进行赔偿，超出部分将由您自行承担。

5. 理赔材料不全或不符合要求：

   • 在申请理赔时，您需要提供一系列的理赔材料，如医疗费用发票、诊断证明、病历等。如果您的理赔材料不全或不符合保险公司的要求，那么保险公司可能会拒绝赔偿或只赔偿部分金额。

建议：

• 仔细阅读保险合同：了解保险合同中的免赔额、赔偿比例、保障范围、保险金额等关键条款，以便更好地理解保险公司的赔偿决策。
• 核对理赔材料：确保您提供的理赔材料齐全、准确，并符合保险公司的要求。
• 与保险公司沟通：如果您对保险公司的赔偿决策有疑问或不满，可以与保险公司进行沟通，了解具体的赔偿计算方式和依据。
• 寻求法律帮助：如果您认为保险公司的赔偿决策存在不公平或不合理之处，可以向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。